Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3478 Pepper.v.1.5.chr07 207383827 3e-23
CaES3497 Pepper.v.1.5.chr07 91863014 1e-146
CaES3505 Pepper.v.1.5.chr07 11518526 1e-104
CaES3515 Pepper.v.1.5.chr07 209746767 1e-77
CaES3530 Pepper.v.1.5.chr07 219460146 1e-125
CaES3536 Pepper.v.1.5.chr07 2395375 1e-121
CaES3548 Pepper.v.1.5.chr07 227090634 1e-130
CaES3553 Pepper.v.1.5.chr07 219649614 1e-78
CaES3567 Pepper.v.1.5.chr07 223688011 1e-122
CaES3580 Pepper.v.1.5.chr07 123678615 2e-29
CaES3589 Pepper.v.1.5.chr07 226496005 1e-122
CaES3597 Pepper.v.1.5.chr07 17458217 1e-138
CaES3646 Pepper.v.1.5.chr07 21666461 4e-35
CaES3652 Pepper.v.1.5.chr07 185482611 1e-24
CaES3657 Pepper.v.1.5.chr07 184428618 1e-125
CaES3659 Pepper.v.1.5.chr07 98452637 1e-123
CaES3660 Pepper.v.1.5.chr07 224032673 6e-60
CaES3661 Pepper.v.1.5.chr07 122218980 1e-129
CaES3698 Pepper.v.1.5.chr07 121048447 8e-62
CaES3699 Pepper.v.1.5.chr07 217490100 2e-56
CaES3722 Pepper.v.1.5.chr07 38221076 1e-154
CaES3731 Pepper.v.1.5.chr07 70169006 1e-145
CaES3744 Pepper.v.1.5.chr07 219773370 1e-121
CaES3746 Pepper.v.1.5.chr07 209840333 5e-91
CaES3760 Pepper.v.1.5.chr07 213527470 3e-84
CaES3764 Pepper.v.1.5.chr07 1314174 1e-121
CaES3775 Pepper.v.1.5.chr07 35120228 2e-79
CaES3793 Pepper.v.1.5.chr07 221249674 1e-130
CaES3808 Pepper.v.1.5.chr07 226875675 1e-123
CaES3831 Pepper.v.1.5.chr07 16110139 1e-65
CaES3834 Pepper.v.1.5.chr07 211505185 1e-82
CaES3847 Pepper.v.1.5.chr07 206871063 7e-97
CaES3850 Pepper.v.1.5.chr07 218997131 1e-110
CaES3856 0.0 78 Pepper.v.1.5.chr07 110274798 5e-93
CaES3870 Pepper.v.1.5.chr07 40352214 2e-88
CaES3880 Pepper.v.1.5.chr07 97601687 1e-111
CaES3886 Pepper.v.1.5.chr07 226733569 7e-43
CaES3889 Pepper.v.1.5.chr07 214624784 4e-97
CaES3904 Pepper.v.1.5.chr07 224286786 1e-104
CaES3912 Pepper.v.1.5.chr07 113341440 4e-67
CaES3919 Pepper.v.1.5.chr07 55939045 1e-65
CaES3922 Pepper.v.1.5.chr07 205439245 7e-76
CaES3934 Pepper.v.1.5.chr07 136767198 2e-36
CaES3937 Pepper.v.1.5.chr07 40350997 1e-81
CaES3942 Pepper.v.1.5.chr07 226962513 1e-118
CaES3948 Pepper.v.1.5.chr07 122825696 2e-97
CaES3963 Pepper.v.1.5.chr07 171590 1e-82
CaES3985 Pepper.v.1.5.chr07 125386505 1e-122
CaES3991 Pepper.v.1.5.chr07 91622669 4e-42
CaES3997 Pepper.v.1.5.chr07 169525445 1e-143
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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