Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4543 Pepper.v.1.5.chr07 197902068 6e-92
CaES0625 Pepper.v.1.5.chr07 197933322 1e-139
CaES1842 Pepper.v.1.5.chr07 198543457 5e-97
CaES0761 Pepper.v.1.5.chr07 200483794 8e-93
CaES0628 Pepper.v.1.5.chr07 200572791 1e-123
CaES0049 Pepper.v.1.5.chr07 201075828 1e-99
CaES2831 Pepper.v.1.5.chr07 201316268 2e-91
CaES4716 Pepper.v.1.5.chr07 201747297 1e-119
CaES2946 Pepper.v.1.5.chr07 202284975 6e-89
CaES4834 Pepper.v.1.5.chr07 203305939 1e-142
CaES0852 Pepper.v.1.5.chr07 203724151 2e-50
CaES5726 Pepper.v.1.5.chr07 203805906 3e-53
CaES0515 Pepper.v.1.5.chr07 203905263 6e-73
CaES1118 Pepper.v.1.5.chr07 204943652 1e-125
CaES1242 Pepper.v.1.5.chr07 205437517 1e-119
CaES3922 Pepper.v.1.5.chr07 205439245 7e-76
CaES4515 Pepper.v.1.5.chr07 205439615 3e-92
CaES1453 Pepper.v.1.5.chr07 205595594 1e-134
CaES0915 Pepper.v.1.5.chr07 205646618 1e-81
CaES2953 Pepper.v.1.5.chr07 205646866 1e-103
CaES0391 Pepper.v.1.5.chr07 205831119 1e-113
CaES3847 Pepper.v.1.5.chr07 206871063 7e-97
CaES2336 Pepper.v.1.5.chr07 206880092 7e-55
CaES1579 Pepper.v.1.5.chr07 207321592 1e-113
CaES3478 Pepper.v.1.5.chr07 207383827 3e-23
CaES4962 Pepper.v.1.5.chr07 207601601 2e-91
CaES3515 Pepper.v.1.5.chr07 209746767 1e-77
CaES3746 Pepper.v.1.5.chr07 209840333 5e-91
CaES1665 Pepper.v.1.5.chr07 209841353 7e-62
CaES4968 Pepper.v.1.5.chr07 209841353 8e-94
CaES0937 Pepper.v.1.5.chr07 209889200 1e-135
CaES1619 Pepper.v.1.5.chr07 209891202 2e-74
CaES0346 Pepper.v.1.5.chr07 209940582 1e-132
CaES5580 Pepper.v.1.5.chr07 210035499 1e-101
CaES2905 Pepper.v.1.5.chr07 211154079 1e-36
CaES4102 Pepper.v.1.5.chr07 211341122 1e-72
CaES2366 Pepper.v.1.5.chr07 211463123 1e-119
CaES3834 Pepper.v.1.5.chr07 211505185 1e-82
CaES2885 Pepper.v.1.5.chr07 211533677 1e-149
CaES2487 Pepper.v.1.5.chr07 212121477 3e-59
CaES5084 Pepper.v.1.5.chr07 213312113 1e-145
CaES2690 Pepper.v.1.5.chr07 213470507 1e-111
CaES3760 Pepper.v.1.5.chr07 213527470 3e-84
CaES3889 Pepper.v.1.5.chr07 214624784 4e-97
CaES4766 Pepper.v.1.5.chr07 214954278 1e-149
CaES1048 Pepper.v.1.5.chr07 215390054 2e-60
CaES2289 Pepper.v.1.5.chr07 215429105 1e-48
CaES1531 Pepper.v.1.5.chr07 215460224 7e-42
CaES0366 Pepper.v.1.5.chr07 215461196 1e-103
CaES4656 Pepper.v.1.5.chr07 215462715 1e-116
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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