Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2724 Pepper.v.1.5.chr07 171174261 9e-81
CaES2747 Pepper.v.1.5.chr07 22280626 1e-113
CaES2753 Pepper.v.1.5.chr07 144683991 1e-142
CaES2788 Pepper.v.1.5.chr07 94776 1e-140
CaES2790 0.339 183 Pepper.v.1.5.chr07 151250398 1e-103
CaES2799 Pepper.v.1.5.chr07 221250788 2e-98
CaES2829 Pepper.v.1.5.chr07 183519111 1e-139
CaES2831 Pepper.v.1.5.chr07 201316268 2e-91
CaES2838 Pepper.v.1.5.chr07 223787013 1e-119
CaES2856 Pepper.v.1.5.chr07 218886665 1e-153
CaES2858 Pepper.v.1.5.chr07 115709250 1e-110
CaES2883 Pepper.v.1.5.chr07 891839 1e-126
CaES2884 Pepper.v.1.5.chr07 2352926 1e-107
CaES2885 Pepper.v.1.5.chr07 211533677 1e-149
CaES2905 Pepper.v.1.5.chr07 211154079 1e-36
CaES2912 Pepper.v.1.5.chr07 225504489 1e-84
CaES2942 Pepper.v.1.5.chr07 223727946 1e-95
CaES2946 Pepper.v.1.5.chr07 202284975 6e-89
CaES2953 Pepper.v.1.5.chr07 205646866 1e-103
CaES2995 Pepper.v.1.5.chr07 73187583 1e-144
CaES3011 Pepper.v.1.5.chr07 177299477 4e-72
CaES3017 Pepper.v.1.5.chr07 5979144 4e-36
CaES3047 Pepper.v.1.5.chr07 217179209 1e-64
CaES3065 Pepper.v.1.5.chr07 223721258 1e-125
CaES3090 Pepper.v.1.5.chr07 117702173 1e-128
CaES3098 Pepper.v.1.5.chr07 38566556 1e-145
CaES3100 Pepper.v.1.5.chr07 91565464 1e-123
CaES3110 Pepper.v.1.5.chr07 221314207 1e-38
CaES3132 Pepper.v.1.5.chr07 122346342 8e-55
CaES3138 Pepper.v.1.5.chr07 50566241 9e-46
CaES3172 Pepper.v.1.5.chr07 19424752 1e-47
CaES3180 Pepper.v.1.5.chr07 666577 7e-71
CaES3183 Pepper.v.1.5.chr07 4011946 2e-33
CaES3200 Pepper.v.1.5.chr07 666818 2e-61
CaES3211 Pepper.v.1.5.chr07 125810717 1e-126
CaES3221 Pepper.v.1.5.chr07 176267448 2e-81
CaES3223 Pepper.v.1.5.chr07 223750041 1e-65
CaES3226 Pepper.v.1.5.chr07 7573114 1e-42
CaES3253 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr07 178886468 1e-145
CaES3281 Pepper.v.1.5.chr07 11952834 1e-112
CaES3289 Pepper.v.1.5.chr07 220915687 2e-93
CaES3296 Pepper.v.1.5.chr07 224430466 7e-81
CaES3366 Pepper.v.1.5.chr07 161243410 2e-58
CaES3388 Pepper.v.1.5.chr07 137183185 1e-107
CaES3393 Pepper.v.1.5.chr07 177039830 1e-130
CaES3396 Pepper.v.1.5.chr07 119268526 1e-119
CaES3410 Pepper.v.1.5.chr07 224134299 1e-138
CaES3415 Pepper.v.1.5.chr07 8425456 2e-83
CaES3442 Pepper.v.1.5.chr07 10004088 1e-122
CaES3445 Pepper.v.1.5.chr07 25425003 1e-145
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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