Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2123 Pepper.v.1.5.chr07 5683812 7e-49
CaES2160 Pepper.v.1.5.chr07 1255351 4e-94
CaES2170 Pepper.v.1.5.chr07 223793269 1e-134
CaES2192 Pepper.v.1.5.chr07 197671637 1e-134
CaES2194 Pepper.v.1.5.chr07 220885318 1e-102
CaES2211 Pepper.v.1.5.chr07 40214120 1e-71
CaES2231 Pepper.v.1.5.chr07 12779945 4e-50
CaES2243 Pepper.v.1.5.chr07 225851316 2e-96
CaES2244 Pepper.v.1.5.chr07 136767303 3e-33
CaES2252 0.011 187 Pepper.v.1.5.chr07 5740142 1e-127
CaES2253 Pepper.v.1.5.chr07 8425459 3e-34
CaES2257 Pepper.v.1.5.chr07 2619479 4e-27
CaES2289 Pepper.v.1.5.chr07 215429105 1e-48
CaES2295 Pepper.v.1.5.chr07 216495537 5e-94
CaES2300 Pepper.v.1.5.chr07 145205541 1e-158
CaES2303 Pepper.v.1.5.chr07 221238260 3e-78
CaES2313 Pepper.v.1.5.chr07 69596117 1e-106
CaES2320 Pepper.v.1.5.chr07 219408723 1e-126
CaES2324 Pepper.v.1.5.chr07 5327723 1e-110
CaES2336 Pepper.v.1.5.chr07 206880092 7e-55
CaES2342 Pepper.v.1.5.chr07 136767198 3e-56
CaES2353 Pepper.v.1.5.chr07 22352428 9e-21
CaES2366 Pepper.v.1.5.chr07 211463123 1e-119
CaES2372 Pepper.v.1.5.chr07 82018272 1e-152
CaES2377 Pepper.v.1.5.chr07 226742741 1e-110
CaES2402 Pepper.v.1.5.chr07 197584630 1e-84
CaES2413 Pepper.v.1.5.chr07 220017268 2e-71
CaES2418 Pepper.v.1.5.chr07 223036904 1e-116
CaES2430 Pepper.v.1.5.chr07 227548463 9e-66
CaES2437 Pepper.v.1.5.chr07 26272540 1e-71
CaES2446 Pepper.v.1.5.chr07 173298507 2e-54
CaES2467 Pepper.v.1.5.chr07 2428229 4e-96
CaES2479 Pepper.v.1.5.chr07 218023210 2e-66
CaES2487 Pepper.v.1.5.chr07 212121477 3e-59
CaES2504 Pepper.v.1.5.chr07 7962663 3e-40
CaES2548 Pepper.v.1.5.chr07 226022798 1e-122
CaES2583 Pepper.v.1.5.chr07 220555465 1e-119
CaES2592 Pepper.v.1.5.chr07 5322522 5e-75
CaES2596 Pepper.v.1.5.chr07 34665202 1e-123
CaES2601 Pepper.v.1.5.chr07 149058412 4e-91
CaES2624 Pepper.v.1.5.chr07 6920174 1e-134
CaES2642 Pepper.v.1.5.chr07 226070269 2e-39
CaES2667 Pepper.v.1.5.chr07 224430466 2e-96
CaES2680 Pepper.v.1.5.chr07 34341645 1e-137
CaES2681 Pepper.v.1.5.chr07 225504148 3e-41
CaES2690 Pepper.v.1.5.chr07 213470507 1e-111
CaES2710 Pepper.v.1.5.chr07 12065278 1e-109
CaES2713 Pepper.v.1.5.chr07 17531743 3e-73
CaES2721 Pepper.v.1.5.chr07 219190011 1e-112
CaES2722 Pepper.v.1.5.chr07 128783976 1e-138
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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