Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1413 Pepper.v.1.5.chr07 225843819 1e-51
CaES1442 Pepper.v.1.5.chr07 184944452 2e-31
CaES1453 Pepper.v.1.5.chr07 205595594 1e-134
CaES1464 Pepper.v.1.5.chr07 184180707 4e-94
CaES1473 Pepper.v.1.5.chr07 666499 6e-88
CaES1482 Pepper.v.1.5.chr07 180564742 2e-50
CaES1492 Pepper.v.1.5.chr07 224768980 2e-71
CaES1500 Pepper.v.1.5.chr07 55949823 4e-76
CaES1506 Pepper.v.1.5.chr07 4065184 5e-95
CaES1515 Pepper.v.1.5.chr07 225543595 2e-70
CaES1519 Pepper.v.1.5.chr07 93463853 1e-112
CaES1531 Pepper.v.1.5.chr07 215460224 7e-42
CaES1535 Pepper.v.1.5.chr07 178391997 1e-97
CaES1540 Pepper.v.1.5.chr07 225141878 1e-81
CaES1572 Pepper.v.1.5.chr07 188742795 3e-64
CaES1579 Pepper.v.1.5.chr07 207321592 1e-113
CaES1585 Pepper.v.1.5.chr07 190892028 3e-67
CaES1597 Pepper.v.1.5.chr07 13664912 7e-29
CaES1599 Pepper.v.1.5.chr07 195275173 2e-89
CaES1619 Pepper.v.1.5.chr07 209891202 2e-74
CaES1625 Pepper.v.1.5.chr07 124874095 5e-53
CaES1659 Pepper.v.1.5.chr07 219229870 1e-154
CaES1665 Pepper.v.1.5.chr07 209841353 7e-62
CaES1680 Pepper.v.1.5.chr07 120186020 1e-92
CaES1718 Pepper.v.1.5.chr07 17954931 4e-27
CaES1764 Pepper.v.1.5.chr07 224134593 1e-119
CaES1803 Pepper.v.1.5.chr07 174778856 1e-120
CaES1813 Pepper.v.1.5.chr07 128538541 1e-146
CaES1817 Pepper.v.1.5.chr07 223165073 2e-45
CaES1842 Pepper.v.1.5.chr07 198543457 5e-97
CaES1845 Pepper.v.1.5.chr07 1791955 4e-69
CaES1854 Pepper.v.1.5.chr07 115700884 1e-122
CaES1861 Pepper.v.1.5.chr07 177855001 1e-159
CaES1893 Pepper.v.1.5.chr07 44459809 1e-129
CaES1926 Pepper.v.1.5.chr07 215670660 1e-115
CaES1931 Pepper.v.1.5.chr07 35020290 5e-84
CaES1933 Pepper.v.1.5.chr07 17271042 4e-56
CaES1938 Pepper.v.1.5.chr07 16110499 1e-100
CaES1965 Pepper.v.1.5.chr07 226070269 1e-148
CaES1996 Pepper.v.1.5.chr07 223250271 4e-71
CaES2027 0.482 189 Pepper.v.1.5.chr07 99474311 1e-112
CaES2031 Pepper.v.1.5.chr07 6247570 1e-123
CaES2040 Pepper.v.1.5.chr07 111425586 1e-106
CaES2046 Pepper.v.1.5.chr07 26300866 1e-122
CaES2052 Pepper.v.1.5.chr07 176254695 1e-110
CaES2073 Pepper.v.1.5.chr07 16075440 5e-74
CaES2083 Pepper.v.1.5.chr07 224895795 1e-125
CaES2092 Pepper.v.1.5.chr07 108142646 1e-146
CaES2102 Pepper.v.1.5.chr07 216564363 2e-67
CaES2108 Pepper.v.1.5.chr07 180122758 1e-123
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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