Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4227 Pepper.v.1.5.chr07 35026384 2e-98
CaES3775 Pepper.v.1.5.chr07 35120228 2e-79
CaES4821 Pepper.v.1.5.chr07 36361636 6e-75
CaES4306 Pepper.v.1.5.chr07 37010875 1e-57
CaES1311 Pepper.v.1.5.chr07 37262127 2e-75
CaES1038 Pepper.v.1.5.chr07 37690138 1e-99
CaES1180 Pepper.v.1.5.chr07 37869104 3e-66
CaES3722 Pepper.v.1.5.chr07 38221076 1e-154
CaES3098 Pepper.v.1.5.chr07 38566556 1e-145
CaES1391 Pepper.v.1.5.chr07 38581744 1e-129
CaES2211 Pepper.v.1.5.chr07 40214120 1e-71
CaES3937 Pepper.v.1.5.chr07 40350997 1e-81
CaES3870 Pepper.v.1.5.chr07 40352214 2e-88
CaES1893 Pepper.v.1.5.chr07 44459809 1e-129
CaES0567 Pepper.v.1.5.chr07 49622246 1e-100
CaES3138 Pepper.v.1.5.chr07 50566241 9e-46
CaES5269 Pepper.v.1.5.chr07 50592586 8e-72
CaES4243 Pepper.v.1.5.chr07 52962942 1e-101
CaES4792 Pepper.v.1.5.chr07 54229376 5e-85
CaES3919 Pepper.v.1.5.chr07 55939045 1e-65
CaES1250 Pepper.v.1.5.chr07 55949642 1e-120
CaES1500 Pepper.v.1.5.chr07 55949823 4e-76
CaES0407 Pepper.v.1.5.chr07 57891884 1e-127
CaES5353 Pepper.v.1.5.chr07 63017521 1e-111
CaES0501 Pepper.v.1.5.chr07 64038636 5e-41
CaES4547 Pepper.v.1.5.chr07 67203161 5e-73
CaES2313 Pepper.v.1.5.chr07 69596117 1e-106
CaES3731 Pepper.v.1.5.chr07 70169006 1e-145
CaES2995 Pepper.v.1.5.chr07 73187583 1e-144
CaES4439 Pepper.v.1.5.chr07 78498245 1e-153
CaES4387 Pepper.v.1.5.chr07 81381509 1e-130
CaES5442 Pepper.v.1.5.chr07 82018172 4e-85
CaES2372 Pepper.v.1.5.chr07 82018272 1e-152
CaES5280 Pepper.v.1.5.chr07 82533651 4e-97
CaES1124 Pepper.v.1.5.chr07 82538382 1e-122
CaES5695 Pepper.v.1.5.chr07 84113195 4e-98
CaES0980 Pepper.v.1.5.chr07 89697001 2e-73
CaES3100 Pepper.v.1.5.chr07 91565464 1e-123
CaES3991 Pepper.v.1.5.chr07 91622669 4e-42
CaES3497 Pepper.v.1.5.chr07 91863014 1e-146
CaES1028 Pepper.v.1.5.chr07 93397786 1e-109
CaES1519 Pepper.v.1.5.chr07 93463853 1e-112
CaES5633 Pepper.v.1.5.chr07 93524914 1e-119
CaES4337 Pepper.v.1.5.chr07 94334990 1e-120
CaES5369 Pepper.v.1.5.chr07 94520393 2e-51
CaES0531 Pepper.v.1.5.chr07 95125742 1e-114
CaES3880 Pepper.v.1.5.chr07 97601687 1e-111
CaES3659 Pepper.v.1.5.chr07 98452637 1e-123
CaES4255 Pepper.v.1.5.chr07 99464301 1e-141
CaES2027 0.482 189 Pepper.v.1.5.chr07 99474311 1e-112
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


MarkerDB | Capsicum annuum