Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0681 Pepper.v.1.5.chr07 156872323 7e-25
CaES0698 Pepper.v.1.5.chr07 814219 1e-125
CaES0740 Pepper.v.1.5.chr07 17537835 1e-88
CaES0750 Pepper.v.1.5.chr07 177356427 1e-133
CaES0755 Pepper.v.1.5.chr07 5663572 1e-120
CaES0761 Pepper.v.1.5.chr07 200483794 8e-93
CaES0773 Pepper.v.1.5.chr07 6157202 4e-60
CaES0792 Pepper.v.1.5.chr07 23669933 3e-28
CaES0798 Pepper.v.1.5.chr07 194176266 1e-93
CaES0826 Pepper.v.1.5.chr07 184257119 2e-71
CaES0833 Pepper.v.1.5.chr07 177355920 9e-34
CaES0842 Pepper.v.1.5.chr07 216238409 5e-52
CaES0852 Pepper.v.1.5.chr07 203724151 2e-50
CaES0869 Pepper.v.1.5.chr07 5645762 1e-106
CaES0896 Pepper.v.1.5.chr07 120916152 1e-108
CaES0913 Pepper.v.1.5.chr07 177962197 1e-155
CaES0915 Pepper.v.1.5.chr07 205646618 1e-81
CaES0920 Pepper.v.1.5.chr07 7514630 1e-129
CaES0936 Pepper.v.1.5.chr07 108143439 1e-131
CaES0937 Pepper.v.1.5.chr07 209889200 1e-135
CaES0944 Pepper.v.1.5.chr07 5639049 1e-124
CaES0952 Pepper.v.1.5.chr07 174641764 2e-53
CaES0971 Pepper.v.1.5.chr07 220430022 1e-132
CaES0980 Pepper.v.1.5.chr07 89697001 2e-73
CaES0992 Pepper.v.1.5.chr07 5567872 2e-33
CaES1006 Pepper.v.1.5.chr07 220158220 1e-119
CaES1028 Pepper.v.1.5.chr07 93397786 1e-109
CaES1032 Pepper.v.1.5.chr07 135487647 2e-98
CaES1036 Pepper.v.1.5.chr07 137931849 1e-124
CaES1038 Pepper.v.1.5.chr07 37690138 1e-99
CaES1048 Pepper.v.1.5.chr07 215390054 2e-60
CaES1118 Pepper.v.1.5.chr07 204943652 1e-125
CaES1124 Pepper.v.1.5.chr07 82538382 1e-122
CaES1136 Pepper.v.1.5.chr07 165060315 1e-141
CaES1180 Pepper.v.1.5.chr07 37869104 3e-66
CaES1188 Pepper.v.1.5.chr07 177855891 5e-91
CaES1233 Pepper.v.1.5.chr07 33034840 1e-134
CaES1242 Pepper.v.1.5.chr07 205437517 1e-119
CaES1244 Pepper.v.1.5.chr07 225981760 1e-130
CaES1250 Pepper.v.1.5.chr07 55949642 1e-120
CaES1291 Pepper.v.1.5.chr07 225549015 1e-130
CaES1300 Pepper.v.1.5.chr07 121868989 1e-116
CaES1309 Pepper.v.1.5.chr07 153761 6e-63
CaES1311 Pepper.v.1.5.chr07 37262127 2e-75
CaES1312 Pepper.v.1.5.chr07 124790813 1e-138
CaES1364 Pepper.v.1.5.chr07 216564363 4e-80
CaES1365 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr07 8099694 1e-100
CaES1381 Pepper.v.1.5.chr07 223763542 2e-94
CaES1391 Pepper.v.1.5.chr07 38581744 1e-129
CaES1398 Pepper.v.1.5.chr07 223760814 1e-122
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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