Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3226 Pepper.v.1.5.chr07 7573114 1e-42
CaES2504 Pepper.v.1.5.chr07 7962663 3e-40
CaES1365 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr07 8099694 1e-100
CaES3415 Pepper.v.1.5.chr07 8425456 2e-83
CaES2253 Pepper.v.1.5.chr07 8425459 3e-34
CaES0399 Pepper.v.1.5.chr07 9625442 1e-116
CaES0139 Pepper.v.1.5.chr07 9810199 2e-54
CaES3442 Pepper.v.1.5.chr07 10004088 1e-122
CaES0087 Pepper.v.1.5.chr07 10005795 1e-120
CaES5279 Pepper.v.1.5.chr07 10031151 1e-109
CaES3505 Pepper.v.1.5.chr07 11518526 1e-104
CaES0644 Pepper.v.1.5.chr07 11518556 3e-94
CaES4266 Pepper.v.1.5.chr07 11519255 2e-40
CaES5665 Pepper.v.1.5.chr07 11633335 1e-146
CaES3281 Pepper.v.1.5.chr07 11952834 1e-112
CaES2710 Pepper.v.1.5.chr07 12065278 1e-109
CaES0016 Pepper.v.1.5.chr07 12640247 1e-111
CaES2231 Pepper.v.1.5.chr07 12779945 4e-50
CaES1597 Pepper.v.1.5.chr07 13664912 7e-29
CaES0245 Pepper.v.1.5.chr07 13716060 1e-103
CaES5397 Pepper.v.1.5.chr07 14980552 2e-78
CaES2073 Pepper.v.1.5.chr07 16075440 5e-74
CaES5513 Pepper.v.1.5.chr07 16098471 5e-40
CaES3831 Pepper.v.1.5.chr07 16110139 1e-65
CaES1938 Pepper.v.1.5.chr07 16110499 1e-100
CaES0557 Pepper.v.1.5.chr07 16236785 1e-113
CaES1933 Pepper.v.1.5.chr07 17271042 4e-56
CaES5211 Pepper.v.1.5.chr07 17276167 1e-83
CaES3597 Pepper.v.1.5.chr07 17458217 1e-138
CaES2713 Pepper.v.1.5.chr07 17531743 3e-73
CaES0740 Pepper.v.1.5.chr07 17537835 1e-88
CaES1718 Pepper.v.1.5.chr07 17954931 4e-27
CaES4749 Pepper.v.1.5.chr07 18254893 1e-115
CaES3172 Pepper.v.1.5.chr07 19424752 1e-47
CaES0305 Pepper.v.1.5.chr07 20171917 1e-113
CaES3646 Pepper.v.1.5.chr07 21666461 4e-35
CaES0600 Pepper.v.1.5.chr07 21969826 1e-111
CaES2747 Pepper.v.1.5.chr07 22280626 1e-113
CaES2353 Pepper.v.1.5.chr07 22352428 9e-21
CaES0792 Pepper.v.1.5.chr07 23669933 3e-28
CaES4360 Pepper.v.1.5.chr07 23670575 1e-108
CaES3445 Pepper.v.1.5.chr07 25425003 1e-145
CaES2437 Pepper.v.1.5.chr07 26272540 1e-71
CaES2046 Pepper.v.1.5.chr07 26300866 1e-122
CaES0590 Pepper.v.1.5.chr07 31627949 1e-25
CaES1233 Pepper.v.1.5.chr07 33034840 1e-134
CaES2680 Pepper.v.1.5.chr07 34341645 1e-137
CaES2596 Pepper.v.1.5.chr07 34665202 1e-123
CaES0322 Pepper.v.1.5.chr07 34904375 6e-99
CaES1931 Pepper.v.1.5.chr07 35020290 5e-84
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


MarkerDB | Capsicum annuum