Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0036 Pepper.v.1.5.chr06 217787077 1e-119
CaES0060 Pepper.v.1.5.chr06 214105825 5e-84
CaES0120 Pepper.v.1.5.chr06 191438597 5e-22
CaES0137 Pepper.v.1.5.chr06 188307826 1e-129
CaES0146 Pepper.v.1.5.chr06 123746453 7e-47
CaES0156 Pepper.v.1.5.chr06 204518791 4e-35
CaES0197 Pepper.v.1.5.chr06 198362086 2e-86
CaES0199 Pepper.v.1.5.chr06 1660201 1e-102
CaES0249 Pepper.v.1.5.chr06 207788755 1e-104
CaES0253 Pepper.v.1.5.chr06 303597 1e-105
CaES0275 Pepper.v.1.5.chr06 197415516 3e-45
CaES0276 Pepper.v.1.5.chr06 94846771 1e-120
CaES0292 Pepper.v.1.5.chr06 58946161 1e-122
CaES0326 Pepper.v.1.5.chr06 203030065 1e-38
CaES0356 Pepper.v.1.5.chr06 161015583 1e-117
CaES0358 Pepper.v.1.5.chr06 69112867 1e-132
CaES0405 Pepper.v.1.5.chr06 181945427 2e-66
CaES0417 Pepper.v.1.5.chr06 204339989 1e-123
CaES0454 Pepper.v.1.5.chr06 202945325 1e-55
CaES0458 Pepper.v.1.5.chr06 203616052 1e-119
CaES0466 Pepper.v.1.5.chr06 210337449 1e-127
CaES0499 Pepper.v.1.5.chr06 212855965 3e-25
CaES0505 Pepper.v.1.5.chr06 214210639 3e-63
CaES0508 Pepper.v.1.5.chr06 214004356 1e-107
CaES0540 Pepper.v.1.5.chr06 170013072 8e-47
CaES0547 Pepper.v.1.5.chr06 204261025 4e-82
CaES0561 Pepper.v.1.5.chr06 160493281 1e-107
CaES0589 Pepper.v.1.5.chr06 203363518 1e-123
CaES0592 Pepper.v.1.5.chr06 157886275 4e-35
CaES0604 Pepper.v.1.5.chr06 202952672 8e-49
CaES0622 Pepper.v.1.5.chr06 205377282 2e-81
CaES0634 Pepper.v.1.5.chr06 189931236 1e-108
CaES0642 Pepper.v.1.5.chr06 20260739 1e-113
CaES0647 Pepper.v.1.5.chr06 202664286 3e-88
CaES0669 Pepper.v.1.5.chr06 158820464 1e-102
CaES0680 Pepper.v.1.5.chr06 217220091 1e-112
CaES0699 Pepper.v.1.5.chr06 146753023 1e-118
CaES0702 Pepper.v.1.5.chr06 258990 1e-110
CaES0709 Pepper.v.1.5.chr06 99554237 2e-69
CaES0715 Pepper.v.1.5.chr06 181821276 1e-126
CaES0751 Pepper.v.1.5.chr06 114235376 8e-25
CaES0766 Pepper.v.1.5.chr06 214043665 1e-166
CaES0804 Pepper.v.1.5.chr06 574358 1e-102
CaES0807 Pepper.v.1.5.chr06 201983083 7e-55
CaES0809 Pepper.v.1.5.chr06 96793643 1e-113
CaES0828 Pepper.v.1.5.chr06 82128 2e-21
CaES0830 Pepper.v.1.5.chr06 185721387 3e-58
CaES0844 Pepper.v.1.5.chr06 196242186 8e-48
CaES0865 Pepper.v.1.5.chr06 152423146 1e-103
CaES0897 Pepper.v.1.5.chr06 213718225 1e-108
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


MarkerDB | Capsicum annuum