Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3801 Pepper.v.1.5.chr06 212431440 1e-35
CaES2147 Pepper.v.1.5.chr06 212827610 1e-71
CaES0499 Pepper.v.1.5.chr06 212855965 3e-25
CaES5271 Pepper.v.1.5.chr06 212941916 7e-86
CaES1568 Pepper.v.1.5.chr06 213022837 1e-31
CaES3907 Pepper.v.1.5.chr06 213064059 3e-65
CaES2774 Pepper.v.1.5.chr06 213147850 1e-158
CaES0934 Pepper.v.1.5.chr06 213271154 1e-124
CaES5504 Pepper.v.1.5.chr06 213465478 3e-91
CaES4148 Pepper.v.1.5.chr06 213507780 1e-121
CaES1096 Pepper.v.1.5.chr06 213605386 1e-138
CaES0897 Pepper.v.1.5.chr06 213718225 1e-108
CaES3041 Pepper.v.1.5.chr06 213786477 2e-23
CaES1682 Pepper.v.1.5.chr06 213786583 7e-81
CaES0508 Pepper.v.1.5.chr06 214004356 1e-107
CaES0766 Pepper.v.1.5.chr06 214043665 1e-166
CaES4554 Pepper.v.1.5.chr06 214088445 3e-93
CaES3765 Pepper.v.1.5.chr06 214090025 1e-73
CaES0060 Pepper.v.1.5.chr06 214105825 5e-84
CaES2948 Pepper.v.1.5.chr06 214128732 3e-99
CaES5735 Pepper.v.1.5.chr06 214203395 2e-32
CaES3305 Pepper.v.1.5.chr06 214209314 1e-124
CaES0505 Pepper.v.1.5.chr06 214210639 3e-63
CaES2889 Pepper.v.1.5.chr06 214963549 1e-131
CaES4758 Pepper.v.1.5.chr06 214964119 1e-132
CaES3613 Pepper.v.1.5.chr06 215219741 1e-120
CaES4249 Pepper.v.1.5.chr06 215220041 1e-34
CaES1829 Pepper.v.1.5.chr06 215233287 1e-142
CaES4964 Pepper.v.1.5.chr06 215281800 1e-137
CaES2161 Pepper.v.1.5.chr06 215374358 2e-74
CaES4538 Pepper.v.1.5.chr06 215390506 3e-96
CaES1181 Pepper.v.1.5.chr06 215664770 1e-42
CaES4825 Pepper.v.1.5.chr06 215992371 2e-96
CaES1732 Pepper.v.1.5.chr06 216022184 5e-62
CaES3192 Pepper.v.1.5.chr06 216191573 3e-29
CaES3952 Pepper.v.1.5.chr06 216316965 3e-84
CaES3516 Pepper.v.1.5.chr06 216421093 1e-134
CaES2813 Pepper.v.1.5.chr06 216462315 1e-144
CaES3645 Pepper.v.1.5.chr06 216462999 3e-65
CaES1530 Pepper.v.1.5.chr06 216850052 1e-100
CaES3772 Pepper.v.1.5.chr06 217113499 9e-84
CaES0680 Pepper.v.1.5.chr06 217220091 1e-112
CaES5723 Pepper.v.1.5.chr06 217386068 1e-108
CaES3643 Pepper.v.1.5.chr06 217513053 1e-134
CaES3122 Pepper.v.1.5.chr06 217572191 5e-46
CaES3935 Pepper.v.1.5.chr06 217572707 1e-31
CaES1303 Pepper.v.1.5.chr06 217721189 3e-52
CaES2089 Pepper.v.1.5.chr06 217785034 5e-61
CaES5184 Pepper.v.1.5.chr06 217785106 1e-134
CaES0036 Pepper.v.1.5.chr06 217787077 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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