Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4903 Pepper.v.1.5.chr06 38532294 1e-108
CaES4912 Pepper.v.1.5.chr06 135962314 1e-106
CaES4916 Pepper.v.1.5.chr06 71060038 1e-111
CaES4931 Pepper.v.1.5.chr06 170126340 1e-101
CaES4948 Pepper.v.1.5.chr06 207790301 2e-76
CaES4964 Pepper.v.1.5.chr06 215281800 1e-137
CaES4995 Pepper.v.1.5.chr06 191267782 4e-43
CaES4997 Pepper.v.1.5.chr06 159286846 1e-142
CaES5077 Pepper.v.1.5.chr06 212254295 2e-82
CaES5110 Pepper.v.1.5.chr06 192027942 3e-36
CaES5143 Pepper.v.1.5.chr06 209400244 1e-102
CaES5172 Pepper.v.1.5.chr06 105453749 1e-110
CaES5184 Pepper.v.1.5.chr06 217785106 1e-134
CaES5201 Pepper.v.1.5.chr06 104817637 2e-81
CaES5236 Pepper.v.1.5.chr06 130482435 1e-134
CaES5243 Pepper.v.1.5.chr06 212101645 3e-72
CaES5253 0.492 187 Pepper.v.1.5.chr06 34503861 8e-33
CaES5266 Pepper.v.1.5.chr06 574358 6e-86
CaES5271 Pepper.v.1.5.chr06 212941916 7e-86
CaES5314 Pepper.v.1.5.chr06 20583193 1e-104
CaES5330 Pepper.v.1.5.chr06 423086 1e-108
CaES5348 Pepper.v.1.5.chr06 157809262 1e-105
CaES5354 Pepper.v.1.5.chr06 202904093 6e-86
CaES5368 Pepper.v.1.5.chr06 195038363 4e-83
CaES5380 Pepper.v.1.5.chr06 207390750 5e-40
CaES5382 Pepper.v.1.5.chr06 16427817 2e-55
CaES5383 Pepper.v.1.5.chr06 97630534 6e-90
CaES5385 Pepper.v.1.5.chr06 117383701 7e-88
CaES5387 Pepper.v.1.5.chr06 196026520 6e-32
CaES5390 Pepper.v.1.5.chr06 37684603 9e-43
CaES5392 0.179 192 Pepper.v.1.5.chr06 1291968 1e-113
CaES5405 Pepper.v.1.5.chr06 212314169 4e-76
CaES5408 Pepper.v.1.5.chr06 37426106 1e-122
CaES5428 Pepper.v.1.5.chr06 50243139 1e-67
CaES5435 Pepper.v.1.5.chr06 116894985 3e-97
CaES5490 Pepper.v.1.5.chr06 66818924 3e-26
CaES5504 Pepper.v.1.5.chr06 213465478 3e-91
CaES5512 0.246 191 Pepper.v.1.5.chr06 58951267 1e-114
CaES5524 Pepper.v.1.5.chr06 4454855 1e-102
CaES5531 Pepper.v.1.5.chr06 114231498 6e-63
CaES5537 Pepper.v.1.5.chr06 28050864 3e-49
CaES5542 Pepper.v.1.5.chr06 8644153 6e-63
CaES5560 Pepper.v.1.5.chr06 187690899 9e-48
CaES5618 Pepper.v.1.5.chr06 66239627 6e-29
CaES5655 Pepper.v.1.5.chr06 6942735 2e-99
CaES5687 Pepper.v.1.5.chr06 119620997 1e-113
CaES5716 Pepper.v.1.5.chr06 157886094 5e-88
CaES5722 Pepper.v.1.5.chr06 211857107 1e-81
CaES5723 Pepper.v.1.5.chr06 217386068 1e-108
CaES5735 Pepper.v.1.5.chr06 214203395 2e-32
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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