Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1146 Pepper.v.1.5.chr06 202035948 3e-86
CaES0647 Pepper.v.1.5.chr06 202664286 3e-88
CaES5354 Pepper.v.1.5.chr06 202904093 6e-86
CaES0454 Pepper.v.1.5.chr06 202945325 1e-55
CaES4635 Pepper.v.1.5.chr06 202945325 1e-55
CaES0604 Pepper.v.1.5.chr06 202952672 8e-49
CaES4859 Pepper.v.1.5.chr06 202996416 1e-111
CaES0326 Pepper.v.1.5.chr06 203030065 1e-38
CaES0589 Pepper.v.1.5.chr06 203363518 1e-123
CaES4712 Pepper.v.1.5.chr06 203364508 1e-129
CaES3246 Pepper.v.1.5.chr06 203367064 3e-57
CaES1802 Pepper.v.1.5.chr06 203448843 1e-135
CaES0458 Pepper.v.1.5.chr06 203616052 1e-119
CaES0547 Pepper.v.1.5.chr06 204261025 4e-82
CaES4690 Pepper.v.1.5.chr06 204339524 6e-38
CaES0417 Pepper.v.1.5.chr06 204339989 1e-123
CaES0156 Pepper.v.1.5.chr06 204518791 4e-35
CaES3827 Pepper.v.1.5.chr06 204521883 2e-62
CaES2503 Pepper.v.1.5.chr06 205058914 4e-45
CaES2720 Pepper.v.1.5.chr06 205281797 1e-94
CaES0622 Pepper.v.1.5.chr06 205377282 2e-81
CaES1393 Pepper.v.1.5.chr06 205467112 1e-100
CaES3412 Pepper.v.1.5.chr06 205649445 1e-132
CaES2321 Pepper.v.1.5.chr06 206216874 1e-136
CaES3439 Pepper.v.1.5.chr06 206658387 1e-153
CaES0995 Pepper.v.1.5.chr06 206884464 1e-51
CaES1631 Pepper.v.1.5.chr06 206896060 3e-32
CaES4084 Pepper.v.1.5.chr06 207118897 1e-108
CaES4309 Pepper.v.1.5.chr06 207390351 1e-87
CaES5380 Pepper.v.1.5.chr06 207390750 5e-40
CaES4819 Pepper.v.1.5.chr06 207651205 6e-46
CaES0249 Pepper.v.1.5.chr06 207788755 1e-104
CaES4948 Pepper.v.1.5.chr06 207790301 2e-76
CaES1320 Pepper.v.1.5.chr06 209294895 1e-110
CaES5143 Pepper.v.1.5.chr06 209400244 1e-102
CaES2806 Pepper.v.1.5.chr06 209620404 1e-136
CaES2476 Pepper.v.1.5.chr06 209632541 1e-40
CaES0466 Pepper.v.1.5.chr06 210337449 1e-127
CaES3473 Pepper.v.1.5.chr06 210398859 3e-68
CaES1518 Pepper.v.1.5.chr06 211091333 3e-72
CaES4703 Pepper.v.1.5.chr06 211118205 1e-26
CaES4536 Pepper.v.1.5.chr06 211827518 4e-39
CaES5722 Pepper.v.1.5.chr06 211857107 1e-81
CaES1355 Pepper.v.1.5.chr06 211948982 2e-47
CaES1866 Pepper.v.1.5.chr06 211972851 1e-110
CaES5243 Pepper.v.1.5.chr06 212101645 3e-72
CaES5077 Pepper.v.1.5.chr06 212254295 2e-82
CaES2644 Pepper.v.1.5.chr06 212312318 1e-122
CaES5405 Pepper.v.1.5.chr06 212314169 4e-76
CaES1571 Pepper.v.1.5.chr06 212382101 2e-39
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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