Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4170 Pepper.v.1.5.chr06 124682686 1e-109
CaES4171 Pepper.v.1.5.chr06 166916088 1e-125
CaES4209 Pepper.v.1.5.chr06 25888521 4e-76
CaES4212 Pepper.v.1.5.chr06 6313230 1e-105
CaES4245 0.011 177 Pepper.v.1.5.chr06 119102557 1e-110
CaES4249 Pepper.v.1.5.chr06 215220041 1e-34
CaES4251 Pepper.v.1.5.chr06 155682525 1e-139
CaES4293 Pepper.v.1.5.chr06 5145837 1e-139
CaES4298 Pepper.v.1.5.chr06 179859091 1e-126
CaES4309 Pepper.v.1.5.chr06 207390351 1e-87
CaES4345 Pepper.v.1.5.chr06 162659490 2e-92
CaES4372 Pepper.v.1.5.chr06 179868086 1e-108
CaES4375 Pepper.v.1.5.chr06 129199386 1e-142
CaES4382 Pepper.v.1.5.chr06 191234211 1e-139
CaES4391 Pepper.v.1.5.chr06 6159124 2e-94
CaES4408 Pepper.v.1.5.chr06 123231953 1e-39
CaES4413 Pepper.v.1.5.chr06 101220457 1e-116
CaES4504 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr06 135889448 1e-112
CaES4512 Pepper.v.1.5.chr06 89069895 1e-134
CaES4529 Pepper.v.1.5.chr06 180704024 6e-80
CaES4536 Pepper.v.1.5.chr06 211827518 4e-39
CaES4538 Pepper.v.1.5.chr06 215390506 3e-96
CaES4554 Pepper.v.1.5.chr06 214088445 3e-93
CaES4560 Pepper.v.1.5.chr06 2546889 1e-146
CaES4570 Pepper.v.1.5.chr06 190700533 1e-121
CaES4577 Pepper.v.1.5.chr06 97813991 3e-83
CaES4599 Pepper.v.1.5.chr06 197355379 6e-90
CaES4624 Pepper.v.1.5.chr06 190733421 1e-125
CaES4635 Pepper.v.1.5.chr06 202945325 1e-55
CaES4642 Pepper.v.1.5.chr06 149524542 3e-90
CaES4666 0.14 192 Pepper.v.1.5.chr06 205082330 1e-151
CaES4676 Pepper.v.1.5.chr06 14632177 6e-85
CaES4690 Pepper.v.1.5.chr06 204339524 6e-38
CaES4702 Pepper.v.1.5.chr06 83417683 7e-88
CaES4703 Pepper.v.1.5.chr06 211118205 1e-26
CaES4712 Pepper.v.1.5.chr06 203364508 1e-129
CaES4723 Pepper.v.1.5.chr06 191438633 8e-41
CaES4758 Pepper.v.1.5.chr06 214964119 1e-132
CaES4761 Pepper.v.1.5.chr06 35241601 6e-95
CaES4783 Pepper.v.1.5.chr06 194111286 1e-115
CaES4788 Pepper.v.1.5.chr06 86381660 1e-62
CaES4798 Pepper.v.1.5.chr06 161643697 1e-120
CaES4819 Pepper.v.1.5.chr06 207651205 6e-46
CaES4825 Pepper.v.1.5.chr06 215992371 2e-96
CaES4832 Pepper.v.1.5.chr06 180571999 2e-48
CaES4854 Pepper.v.1.5.chr06 190814936 1e-122
CaES4859 Pepper.v.1.5.chr06 202996416 1e-111
CaES4876 Pepper.v.1.5.chr06 112960304 1e-151
CaES4877 Pepper.v.1.5.chr06 595852 8e-59
CaES4895 Pepper.v.1.5.chr06 37682626 1e-101
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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