Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES3305 Pepper.v.1.5.chr06 214209314 1e-124
CaES3321 Pepper.v.1.5.chr06 131095532 1e-58
CaES3356 Pepper.v.1.5.chr06 165555652 1e-33
CaES3389 Pepper.v.1.5.chr06 6608273 1e-103
CaES3405 Pepper.v.1.5.chr06 200190211 1e-91
CaES3412 Pepper.v.1.5.chr06 205649445 1e-132
CaES3421 Pepper.v.1.5.chr06 86660374 2e-86
CaES3439 Pepper.v.1.5.chr06 206658387 1e-153
CaES3473 Pepper.v.1.5.chr06 210398859 3e-68
CaES3495 Pepper.v.1.5.chr06 100198294 1e-108
CaES3516 Pepper.v.1.5.chr06 216421093 1e-134
CaES3570 Pepper.v.1.5.chr06 157806221 1e-112
CaES3610 Pepper.v.1.5.chr06 67843232 1e-126
CaES3613 Pepper.v.1.5.chr06 215219741 1e-120
CaES3621 Pepper.v.1.5.chr06 155682629 1e-163
CaES3636 Pepper.v.1.5.chr06 92682879 1e-154
CaES3639 Pepper.v.1.5.chr06 169297971 1e-121
CaES3643 Pepper.v.1.5.chr06 217513053 1e-134
CaES3645 Pepper.v.1.5.chr06 216462999 3e-65
CaES3684 Pepper.v.1.5.chr06 18582092 1e-143
CaES3723 Pepper.v.1.5.chr06 201796860 1e-121
CaES3754 Pepper.v.1.5.chr06 152480168 3e-92
CaES3765 Pepper.v.1.5.chr06 214090025 1e-73
CaES3772 Pepper.v.1.5.chr06 217113499 9e-84
CaES3773 Pepper.v.1.5.chr06 94848664 1e-127
CaES3801 Pepper.v.1.5.chr06 212431440 1e-35
CaES3803 Pepper.v.1.5.chr06 180451447 5e-39
CaES3820 Pepper.v.1.5.chr06 4126613 5e-95
CaES3826 Pepper.v.1.5.chr06 125340289 1e-105
CaES3827 Pepper.v.1.5.chr06 204521883 2e-62
CaES3829 Pepper.v.1.5.chr06 157516480 2e-50
CaES3907 Pepper.v.1.5.chr06 213064059 3e-65
CaES3935 Pepper.v.1.5.chr06 217572707 1e-31
CaES3952 Pepper.v.1.5.chr06 216316965 3e-84
CaES3965 Pepper.v.1.5.chr06 101219091 2e-90
CaES3988 Pepper.v.1.5.chr06 55683506 1e-136
CaES4008 Pepper.v.1.5.chr06 171125637 4e-26
CaES4009 Pepper.v.1.5.chr06 184822231 1e-124
CaES4010 Pepper.v.1.5.chr06 195909614 1e-115
CaES4024 Pepper.v.1.5.chr06 162659490 5e-96
CaES4030 Pepper.v.1.5.chr06 16654207 2e-87
CaES4031 Pepper.v.1.5.chr06 161858062 4e-28
CaES4039 Pepper.v.1.5.chr06 116229450 1e-104
CaES4079 Pepper.v.1.5.chr06 170023614 1e-134
CaES4084 Pepper.v.1.5.chr06 207118897 1e-108
CaES4127 Pepper.v.1.5.chr06 37427871 1e-126
CaES4134 Pepper.v.1.5.chr06 38098545 1e-107
CaES4145 Pepper.v.1.5.chr06 161364754 1e-121
CaES4146 Pepper.v.1.5.chr06 199597689 8e-75
CaES4148 Pepper.v.1.5.chr06 213507780 1e-121
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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