Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0830 Pepper.v.1.5.chr06 185721387 3e-58
CaES5560 Pepper.v.1.5.chr06 187690899 9e-48
CaES1414 Pepper.v.1.5.chr06 187693537 7e-83
CaES0137 Pepper.v.1.5.chr06 188307826 1e-129
CaES2378 Pepper.v.1.5.chr06 189778790 2e-87
CaES0634 Pepper.v.1.5.chr06 189931236 1e-108
CaES4570 Pepper.v.1.5.chr06 190700533 1e-121
CaES4624 Pepper.v.1.5.chr06 190733421 1e-125
CaES4854 Pepper.v.1.5.chr06 190814936 1e-122
CaES1094 Pepper.v.1.5.chr06 190945520 1e-25
CaES1063 Pepper.v.1.5.chr06 191198811 5e-98
CaES4382 Pepper.v.1.5.chr06 191234211 1e-139
CaES4995 Pepper.v.1.5.chr06 191267782 4e-43
CaES3304 Pepper.v.1.5.chr06 191408680 1e-66
CaES0120 Pepper.v.1.5.chr06 191438597 5e-22
CaES4723 Pepper.v.1.5.chr06 191438633 8e-41
CaES1714 Pepper.v.1.5.chr06 191438838 1e-120
CaES1029 Pepper.v.1.5.chr06 191531407 8e-94
CaES2030 Pepper.v.1.5.chr06 191606326 1e-137
CaES5110 Pepper.v.1.5.chr06 192027942 3e-36
CaES4783 Pepper.v.1.5.chr06 194111286 1e-115
CaES1238 Pepper.v.1.5.chr06 194278849 1e-129
CaES5368 Pepper.v.1.5.chr06 195038363 4e-83
CaES2186 Pepper.v.1.5.chr06 195202599 4e-89
CaES0899 Pepper.v.1.5.chr06 195865873 1e-100
CaES4010 Pepper.v.1.5.chr06 195909614 1e-115
CaES5387 Pepper.v.1.5.chr06 196026520 6e-32
CaES0844 Pepper.v.1.5.chr06 196242186 8e-48
CaES1762 Pepper.v.1.5.chr06 196287522 9e-99
CaES2484 Pepper.v.1.5.chr06 196631784 3e-57
CaES1941 Pepper.v.1.5.chr06 196642679 1e-120
CaES2041 Pepper.v.1.5.chr06 197271325 1e-147
CaES4599 Pepper.v.1.5.chr06 197355379 6e-90
CaES0275 Pepper.v.1.5.chr06 197415516 3e-45
CaES1634 Pepper.v.1.5.chr06 197425971 4e-93
CaES0197 Pepper.v.1.5.chr06 198362086 2e-86
CaES2757 Pepper.v.1.5.chr06 198765176 1e-129
CaES2475 Pepper.v.1.5.chr06 198767585 2e-71
CaES3093 Pepper.v.1.5.chr06 199314947 1e-121
CaES4146 Pepper.v.1.5.chr06 199597689 8e-75
CaES1871 Pepper.v.1.5.chr06 199683909 1e-106
CaES2861 Pepper.v.1.5.chr06 199748474 3e-33
CaES2702 Pepper.v.1.5.chr06 199749124 1e-88
CaES3405 Pepper.v.1.5.chr06 200190211 1e-91
CaES1026 Pepper.v.1.5.chr06 200456975 1e-121
CaES1573 Pepper.v.1.5.chr06 201147791 7e-71
CaES3723 Pepper.v.1.5.chr06 201796860 1e-121
CaES2516 Pepper.v.1.5.chr06 201920199 1e-85
CaES0807 Pepper.v.1.5.chr06 201983083 7e-55
CaES1146 Pepper.v.1.5.chr06 202035948 3e-86
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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