Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4997 Pepper.v.1.5.chr06 159286846 1e-142
CaES1044 Pepper.v.1.5.chr06 159287020 1e-136
CaES0561 Pepper.v.1.5.chr06 160493281 1e-107
CaES0356 Pepper.v.1.5.chr06 161015583 1e-117
CaES4145 Pepper.v.1.5.chr06 161364754 1e-121
CaES4798 Pepper.v.1.5.chr06 161643697 1e-120
CaES2842 Pepper.v.1.5.chr06 161673276 1e-140
CaES4031 Pepper.v.1.5.chr06 161858062 4e-28
CaES1902 Pepper.v.1.5.chr06 162170334 1e-118
CaES4024 Pepper.v.1.5.chr06 162659490 5e-96
CaES4345 Pepper.v.1.5.chr06 162659490 2e-92
CaES2703 Pepper.v.1.5.chr06 163924296 1e-116
CaES1101 Pepper.v.1.5.chr06 165525763 1e-111
CaES3356 Pepper.v.1.5.chr06 165555652 1e-33
CaES2982 Pepper.v.1.5.chr06 165836562 9e-65
CaES3119 Pepper.v.1.5.chr06 166542741 1e-145
CaES1595 Pepper.v.1.5.chr06 166913427 6e-54
CaES4171 Pepper.v.1.5.chr06 166916088 1e-125
CaES1721 Pepper.v.1.5.chr06 166929287 1e-115
CaES3160 Pepper.v.1.5.chr06 167128287 1e-115
CaES0907 Pepper.v.1.5.chr06 168273250 1e-122
CaES3639 Pepper.v.1.5.chr06 169297971 1e-121
CaES1848 Pepper.v.1.5.chr06 169939772 1e-144
CaES0540 Pepper.v.1.5.chr06 170013072 8e-47
CaES4079 Pepper.v.1.5.chr06 170023614 1e-134
CaES4931 Pepper.v.1.5.chr06 170126340 1e-101
CaES1154 Pepper.v.1.5.chr06 171085472 1e-103
CaES4008 Pepper.v.1.5.chr06 171125637 4e-26
CaES1881 Pepper.v.1.5.chr06 172376794 6e-87
CaES2139 Pepper.v.1.5.chr06 172699892 1e-125
CaES1821 Pepper.v.1.5.chr06 174649109 6e-71
CaES2643 Pepper.v.1.5.chr06 176692593 1e-117
CaES1653 Pepper.v.1.5.chr06 177147500 1e-116
CaES2694 Pepper.v.1.5.chr06 178080196 7e-93
CaES2084 Pepper.v.1.5.chr06 178863459 1e-133
CaES3121 Pepper.v.1.5.chr06 179111312 1e-153
CaES2853 Pepper.v.1.5.chr06 179512622 2e-71
CaES4298 Pepper.v.1.5.chr06 179859091 1e-126
CaES4372 Pepper.v.1.5.chr06 179868086 1e-108
CaES1466 Pepper.v.1.5.chr06 180294121 1e-112
CaES3803 Pepper.v.1.5.chr06 180451447 5e-39
CaES4832 Pepper.v.1.5.chr06 180571999 2e-48
CaES4529 Pepper.v.1.5.chr06 180704024 6e-80
CaES1728 Pepper.v.1.5.chr06 180985577 6e-60
CaES2327 Pepper.v.1.5.chr06 181760733 1e-106
CaES0715 Pepper.v.1.5.chr06 181821276 1e-126
CaES0405 Pepper.v.1.5.chr06 181945427 2e-66
CaES2896 Pepper.v.1.5.chr06 182857456 1e-152
CaES3215 Pepper.v.1.5.chr06 184085535 3e-60
CaES1160 Pepper.v.1.5.chr06 184623533 1e-118
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


MarkerDB | Capsicum annuum