Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2522 Pepper.v.1.5.chr06 110654868 1e-110
CaES2609 Pepper.v.1.5.chr06 895830 1e-124
CaES2643 Pepper.v.1.5.chr06 176692593 1e-117
CaES2644 Pepper.v.1.5.chr06 212312318 1e-122
CaES2662 Pepper.v.1.5.chr06 135919658 1e-132
CaES2694 Pepper.v.1.5.chr06 178080196 7e-93
CaES2702 Pepper.v.1.5.chr06 199749124 1e-88
CaES2703 Pepper.v.1.5.chr06 163924296 1e-116
CaES2720 Pepper.v.1.5.chr06 205281797 1e-94
CaES2730 Pepper.v.1.5.chr06 20538159 5e-75
CaES2757 Pepper.v.1.5.chr06 198765176 1e-129
CaES2772 Pepper.v.1.5.chr06 14773392 1e-108
CaES2774 Pepper.v.1.5.chr06 213147850 1e-158
CaES2777 Pepper.v.1.5.chr06 50254481 3e-48
CaES2778 Pepper.v.1.5.chr06 140415929 1e-113
CaES2806 Pepper.v.1.5.chr06 209620404 1e-136
CaES2813 Pepper.v.1.5.chr06 216462315 1e-144
CaES2842 Pepper.v.1.5.chr06 161673276 1e-140
CaES2853 Pepper.v.1.5.chr06 179512622 2e-71
CaES2861 Pepper.v.1.5.chr06 199748474 3e-33
CaES2865 0.707 169 Pepper.v.1.5.chr06 11997410 1e-80
CaES2871 Pepper.v.1.5.chr06 132485209 1e-117
CaES2889 Pepper.v.1.5.chr06 214963549 1e-131
CaES2896 Pepper.v.1.5.chr06 182857456 1e-152
CaES2921 Pepper.v.1.5.chr06 18609672 1e-100
CaES2931 Pepper.v.1.5.chr06 78997782 1e-130
CaES2948 Pepper.v.1.5.chr06 214128732 3e-99
CaES2982 Pepper.v.1.5.chr06 165836562 9e-65
CaES2986 Pepper.v.1.5.chr06 65331954 1e-113
CaES2993 Pepper.v.1.5.chr06 20530536 1e-27
CaES3004 Pepper.v.1.5.chr06 424037 1e-156
CaES3041 Pepper.v.1.5.chr06 213786477 2e-23
CaES3048 Pepper.v.1.5.chr06 143541373 1e-134
CaES3053 Pepper.v.1.5.chr06 6158718 3e-28
CaES3060 Pepper.v.1.5.chr06 47238633 1e-103
CaES3063 Pepper.v.1.5.chr06 104153392 2e-73
CaES3074 Pepper.v.1.5.chr06 5962658 1e-126
CaES3093 Pepper.v.1.5.chr06 199314947 1e-121
CaES3119 Pepper.v.1.5.chr06 166542741 1e-145
CaES3121 Pepper.v.1.5.chr06 179111312 1e-153
CaES3122 Pepper.v.1.5.chr06 217572191 5e-46
CaES3160 Pepper.v.1.5.chr06 167128287 1e-115
CaES3192 Pepper.v.1.5.chr06 216191573 3e-29
CaES3215 Pepper.v.1.5.chr06 184085535 3e-60
CaES3220 Pepper.v.1.5.chr06 22105265 1e-116
CaES3246 Pepper.v.1.5.chr06 203367064 3e-57
CaES3283 Pepper.v.1.5.chr06 68192538 4e-60
CaES3290 Pepper.v.1.5.chr06 89864253 1e-65
CaES3301 Pepper.v.1.5.chr06 130481846 1e-104
CaES3304 Pepper.v.1.5.chr06 191408680 1e-66
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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