Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1631 Pepper.v.1.5.chr06 206896060 3e-32
CaES1634 Pepper.v.1.5.chr06 197425971 4e-93
CaES1651 Pepper.v.1.5.chr06 49551571 1e-126
CaES1653 Pepper.v.1.5.chr06 177147500 1e-116
CaES1682 Pepper.v.1.5.chr06 213786583 7e-81
CaES1714 Pepper.v.1.5.chr06 191438838 1e-120
CaES1721 Pepper.v.1.5.chr06 166929287 1e-115
CaES1728 Pepper.v.1.5.chr06 180985577 6e-60
CaES1732 Pepper.v.1.5.chr06 216022184 5e-62
CaES1762 Pepper.v.1.5.chr06 196287522 9e-99
CaES1797 Pepper.v.1.5.chr06 34569867 3e-95
CaES1798 Pepper.v.1.5.chr06 122929234 1e-77
CaES1802 Pepper.v.1.5.chr06 203448843 1e-135
CaES1811 0.463 166 Pepper.v.1.5.chr06 163142557 1e-146
CaES1821 Pepper.v.1.5.chr06 174649109 6e-71
CaES1829 Pepper.v.1.5.chr06 215233287 1e-142
CaES1848 Pepper.v.1.5.chr06 169939772 1e-144
CaES1865 Pepper.v.1.5.chr06 253563 1e-121
CaES1866 Pepper.v.1.5.chr06 211972851 1e-110
CaES1871 Pepper.v.1.5.chr06 199683909 1e-106
CaES1881 Pepper.v.1.5.chr06 172376794 6e-87
CaES1891 Pepper.v.1.5.chr06 124676948 4e-54
CaES1902 Pepper.v.1.5.chr06 162170334 1e-118
CaES1941 Pepper.v.1.5.chr06 196642679 1e-120
CaES2030 Pepper.v.1.5.chr06 191606326 1e-137
CaES2041 Pepper.v.1.5.chr06 197271325 1e-147
CaES2050 Pepper.v.1.5.chr06 142451879 2e-21
CaES2053 Pepper.v.1.5.chr06 8371300 1e-143
CaES2056 Pepper.v.1.5.chr06 37456606 1e-116
CaES2084 Pepper.v.1.5.chr06 178863459 1e-133
CaES2089 Pepper.v.1.5.chr06 217785034 5e-61
CaES2139 Pepper.v.1.5.chr06 172699892 1e-125
CaES2147 Pepper.v.1.5.chr06 212827610 1e-71
CaES2159 Pepper.v.1.5.chr06 67392425 1e-149
CaES2161 Pepper.v.1.5.chr06 215374358 2e-74
CaES2186 Pepper.v.1.5.chr06 195202599 4e-89
CaES2256 Pepper.v.1.5.chr06 140602196 1e-129
CaES2291 Pepper.v.1.5.chr06 25305841 1e-112
CaES2299 Pepper.v.1.5.chr06 6387841 2e-37
CaES2321 Pepper.v.1.5.chr06 206216874 1e-136
CaES2327 Pepper.v.1.5.chr06 181760733 1e-106
CaES2341 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr06 75589379 1e-123
CaES2378 Pepper.v.1.5.chr06 189778790 2e-87
CaES2412 Pepper.v.1.5.chr06 122391667 1e-102
CaES2415 Pepper.v.1.5.chr06 123393819 1e-116
CaES2475 Pepper.v.1.5.chr06 198767585 2e-71
CaES2476 Pepper.v.1.5.chr06 209632541 1e-40
CaES2484 Pepper.v.1.5.chr06 196631784 3e-57
CaES2503 Pepper.v.1.5.chr06 205058914 4e-45
CaES2516 Pepper.v.1.5.chr06 201920199 1e-85
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350

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