Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2522 Pepper.v.1.5.chr06 110654868 1e-110
CaES1042 Pepper.v.1.5.chr06 111655746 3e-48
CaES0923 Pepper.v.1.5.chr06 112210022 1e-134
CaES4876 Pepper.v.1.5.chr06 112960304 1e-151
CaES5531 Pepper.v.1.5.chr06 114231498 6e-63
CaES1231 Pepper.v.1.5.chr06 114231567 2e-87
CaES0751 Pepper.v.1.5.chr06 114235376 8e-25
CaES4039 Pepper.v.1.5.chr06 116229450 1e-104
CaES5435 Pepper.v.1.5.chr06 116894985 3e-97
CaES5385 Pepper.v.1.5.chr06 117383701 7e-88
CaES4245 0.011 177 Pepper.v.1.5.chr06 119102557 1e-110
CaES5687 Pepper.v.1.5.chr06 119620997 1e-113
CaES2412 Pepper.v.1.5.chr06 122391667 1e-102
CaES1798 Pepper.v.1.5.chr06 122929234 1e-77
CaES4408 Pepper.v.1.5.chr06 123231953 1e-39
CaES2415 Pepper.v.1.5.chr06 123393819 1e-116
CaES0146 Pepper.v.1.5.chr06 123746453 7e-47
CaES1891 Pepper.v.1.5.chr06 124676948 4e-54
CaES4170 Pepper.v.1.5.chr06 124682686 1e-109
CaES1521 Pepper.v.1.5.chr06 124684943 1e-135
CaES3826 Pepper.v.1.5.chr06 125340289 1e-105
CaES4375 Pepper.v.1.5.chr06 129199386 1e-142
CaES3301 Pepper.v.1.5.chr06 130481846 1e-104
CaES5236 Pepper.v.1.5.chr06 130482435 1e-134
CaES3321 Pepper.v.1.5.chr06 131095532 1e-58
CaES2871 Pepper.v.1.5.chr06 132485209 1e-117
CaES4504 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr06 135889448 1e-112
CaES2662 Pepper.v.1.5.chr06 135919658 1e-132
CaES4912 Pepper.v.1.5.chr06 135962314 1e-106
CaES2778 Pepper.v.1.5.chr06 140415929 1e-113
CaES2256 Pepper.v.1.5.chr06 140602196 1e-129
CaES1360 Pepper.v.1.5.chr06 142430679 1e-51
CaES2050 Pepper.v.1.5.chr06 142451879 2e-21
CaES3048 Pepper.v.1.5.chr06 143541373 1e-134
CaES0699 Pepper.v.1.5.chr06 146753023 1e-118
CaES4642 Pepper.v.1.5.chr06 149524542 3e-90
CaES1103 Pepper.v.1.5.chr06 151923690 1e-114
CaES0865 Pepper.v.1.5.chr06 152423146 1e-103
CaES3754 Pepper.v.1.5.chr06 152480168 3e-92
CaES4251 Pepper.v.1.5.chr06 155682525 1e-139
CaES3621 Pepper.v.1.5.chr06 155682629 1e-163
CaES1010 Pepper.v.1.5.chr06 157429489 1e-38
CaES3829 Pepper.v.1.5.chr06 157516480 2e-50
CaES3570 Pepper.v.1.5.chr06 157806221 1e-112
CaES5348 Pepper.v.1.5.chr06 157809262 1e-105
CaES5716 Pepper.v.1.5.chr06 157886094 5e-88
CaES0592 Pepper.v.1.5.chr06 157886275 4e-35
CaES0669 Pepper.v.1.5.chr06 158820464 1e-102
CaES4997 Pepper.v.1.5.chr06 159286846 1e-142
CaES1044 Pepper.v.1.5.chr06 159287020 1e-136
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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