Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4209 Pepper.v.1.5.chr06 25888521 4e-76
CaES5537 Pepper.v.1.5.chr06 28050864 3e-49
CaES1797 Pepper.v.1.5.chr06 34569867 3e-95
CaES4761 Pepper.v.1.5.chr06 35241601 6e-95
CaES5408 Pepper.v.1.5.chr06 37426106 1e-122
CaES4127 Pepper.v.1.5.chr06 37427871 1e-126
CaES2056 Pepper.v.1.5.chr06 37456606 1e-116
CaES4895 Pepper.v.1.5.chr06 37682626 1e-101
CaES5390 Pepper.v.1.5.chr06 37684603 9e-43
CaES4134 Pepper.v.1.5.chr06 38098545 1e-107
CaES4903 Pepper.v.1.5.chr06 38532294 1e-108
CaES0945 Pepper.v.1.5.chr06 38533653 1e-118
CaES0903 Pepper.v.1.5.chr06 46933379 1e-104
CaES1215 Pepper.v.1.5.chr06 47237959 1e-124
CaES3060 Pepper.v.1.5.chr06 47238633 1e-103
CaES1651 Pepper.v.1.5.chr06 49551571 1e-126
CaES5428 Pepper.v.1.5.chr06 50243139 1e-67
CaES2777 Pepper.v.1.5.chr06 50254481 3e-48
CaES1216 Pepper.v.1.5.chr06 50267320 9e-50
CaES3988 Pepper.v.1.5.chr06 55683506 1e-136
CaES0292 Pepper.v.1.5.chr06 58946161 1e-122
CaES1463 Pepper.v.1.5.chr06 61103439 1e-121
CaES2986 Pepper.v.1.5.chr06 65331954 1e-113
CaES5618 Pepper.v.1.5.chr06 66239627 6e-29
CaES5490 Pepper.v.1.5.chr06 66818924 3e-26
CaES2159 Pepper.v.1.5.chr06 67392425 1e-149
CaES3610 Pepper.v.1.5.chr06 67843232 1e-126
CaES3283 Pepper.v.1.5.chr06 68192538 4e-60
CaES1267 Pepper.v.1.5.chr06 69111878 1e-134
CaES0358 Pepper.v.1.5.chr06 69112867 1e-132
CaES4916 Pepper.v.1.5.chr06 71060038 1e-111
CaES2931 Pepper.v.1.5.chr06 78997782 1e-130
CaES1030 Pepper.v.1.5.chr06 80744939 3e-49
CaES4702 Pepper.v.1.5.chr06 83417683 7e-88
CaES4788 Pepper.v.1.5.chr06 86381660 1e-62
CaES3421 Pepper.v.1.5.chr06 86660374 2e-86
CaES1449 Pepper.v.1.5.chr06 89060856 2e-72
CaES4512 Pepper.v.1.5.chr06 89069895 1e-134
CaES3290 Pepper.v.1.5.chr06 89864253 1e-65
CaES3636 Pepper.v.1.5.chr06 92682879 1e-154
CaES0276 Pepper.v.1.5.chr06 94846771 1e-120
CaES3773 Pepper.v.1.5.chr06 94848664 1e-127
CaES0809 Pepper.v.1.5.chr06 96793643 1e-113
CaES5383 Pepper.v.1.5.chr06 97630534 6e-90
CaES4577 Pepper.v.1.5.chr06 97813991 3e-83
CaES0709 Pepper.v.1.5.chr06 99554237 2e-69
CaES3495 Pepper.v.1.5.chr06 100198294 1e-108
CaES3965 Pepper.v.1.5.chr06 101219091 2e-90
CaES4413 Pepper.v.1.5.chr06 101220457 1e-116
CaES3063 Pepper.v.1.5.chr06 104153392 2e-73
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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