Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0899 Pepper.v.1.5.chr06 195865873 1e-100
CaES0903 Pepper.v.1.5.chr06 46933379 1e-104
CaES0907 Pepper.v.1.5.chr06 168273250 1e-122
CaES0923 Pepper.v.1.5.chr06 112210022 1e-134
CaES0934 Pepper.v.1.5.chr06 213271154 1e-124
CaES0945 Pepper.v.1.5.chr06 38533653 1e-118
CaES0963 Pepper.v.1.5.chr06 5741418 6e-82
CaES0995 Pepper.v.1.5.chr06 206884464 1e-51
CaES1010 Pepper.v.1.5.chr06 157429489 1e-38
CaES1024 Pepper.v.1.5.chr06 20744556 9e-73
CaES1026 Pepper.v.1.5.chr06 200456975 1e-121
CaES1029 Pepper.v.1.5.chr06 191531407 8e-94
CaES1030 Pepper.v.1.5.chr06 80744939 3e-49
CaES1039 Pepper.v.1.5.chr06 6418492 1e-94
CaES1042 Pepper.v.1.5.chr06 111655746 3e-48
CaES1044 Pepper.v.1.5.chr06 159287020 1e-136
CaES1063 Pepper.v.1.5.chr06 191198811 5e-98
CaES1094 Pepper.v.1.5.chr06 190945520 1e-25
CaES1096 Pepper.v.1.5.chr06 213605386 1e-138
CaES1101 Pepper.v.1.5.chr06 165525763 1e-111
CaES1103 Pepper.v.1.5.chr06 151923690 1e-114
CaES1132 Pepper.v.1.5.chr06 104162195 3e-91
CaES1146 Pepper.v.1.5.chr06 202035948 3e-86
CaES1154 Pepper.v.1.5.chr06 171085472 1e-103
CaES1160 Pepper.v.1.5.chr06 184623533 1e-118
CaES1181 Pepper.v.1.5.chr06 215664770 1e-42
CaES1215 Pepper.v.1.5.chr06 47237959 1e-124
CaES1216 Pepper.v.1.5.chr06 50267320 9e-50
CaES1231 Pepper.v.1.5.chr06 114231567 2e-87
CaES1238 Pepper.v.1.5.chr06 194278849 1e-129
CaES1267 Pepper.v.1.5.chr06 69111878 1e-134
CaES1303 Pepper.v.1.5.chr06 217721189 3e-52
CaES1320 Pepper.v.1.5.chr06 209294895 1e-110
CaES1355 Pepper.v.1.5.chr06 211948982 2e-47
CaES1360 Pepper.v.1.5.chr06 142430679 1e-51
CaES1393 Pepper.v.1.5.chr06 205467112 1e-100
CaES1403 Pepper.v.1.5.chr06 106161735 1e-124
CaES1411 Pepper.v.1.5.chr06 532877 2e-85
CaES1414 Pepper.v.1.5.chr06 187693537 7e-83
CaES1449 Pepper.v.1.5.chr06 89060856 2e-72
CaES1463 Pepper.v.1.5.chr06 61103439 1e-121
CaES1466 Pepper.v.1.5.chr06 180294121 1e-112
CaES1518 Pepper.v.1.5.chr06 211091333 3e-72
CaES1521 Pepper.v.1.5.chr06 124684943 1e-135
CaES1530 Pepper.v.1.5.chr06 216850052 1e-100
CaES1568 Pepper.v.1.5.chr06 213022837 1e-31
CaES1571 Pepper.v.1.5.chr06 212382101 2e-39
CaES1573 Pepper.v.1.5.chr06 201147791 7e-71
CaES1591 Pepper.v.1.5.chr06 6431690 2e-21
CaES1595 Pepper.v.1.5.chr06 166913427 6e-54
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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