Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr06

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 350


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0828 Pepper.v.1.5.chr06 82128 2e-21
CaES1865 Pepper.v.1.5.chr06 253563 1e-121
CaES0702 Pepper.v.1.5.chr06 258990 1e-110
CaES0253 Pepper.v.1.5.chr06 303597 1e-105
CaES5330 Pepper.v.1.5.chr06 423086 1e-108
CaES3004 Pepper.v.1.5.chr06 424037 1e-156
CaES1411 Pepper.v.1.5.chr06 532877 2e-85
CaES0804 Pepper.v.1.5.chr06 574358 1e-102
CaES5266 Pepper.v.1.5.chr06 574358 6e-86
CaES4877 Pepper.v.1.5.chr06 595852 8e-59
CaES2609 Pepper.v.1.5.chr06 895830 1e-124
CaES5392 0.179 192 Pepper.v.1.5.chr06 1291968 1e-113
CaES0199 Pepper.v.1.5.chr06 1660201 1e-102
CaES4560 Pepper.v.1.5.chr06 2546889 1e-146
CaES3820 Pepper.v.1.5.chr06 4126613 5e-95
CaES5524 Pepper.v.1.5.chr06 4454855 1e-102
CaES4293 Pepper.v.1.5.chr06 5145837 1e-139
CaES0963 Pepper.v.1.5.chr06 5741418 6e-82
CaES3074 Pepper.v.1.5.chr06 5962658 1e-126
CaES3053 Pepper.v.1.5.chr06 6158718 3e-28
CaES4391 Pepper.v.1.5.chr06 6159124 2e-94
CaES4212 Pepper.v.1.5.chr06 6313230 1e-105
CaES2299 Pepper.v.1.5.chr06 6387841 2e-37
CaES1039 Pepper.v.1.5.chr06 6418492 1e-94
CaES1591 Pepper.v.1.5.chr06 6431690 2e-21
CaES3389 Pepper.v.1.5.chr06 6608273 1e-103
CaES5655 Pepper.v.1.5.chr06 6942735 2e-99
CaES2053 Pepper.v.1.5.chr06 8371300 1e-143
CaES5542 Pepper.v.1.5.chr06 8644153 6e-63
CaES2865 0.707 169 Pepper.v.1.5.chr06 11997410 1e-80
CaES4676 Pepper.v.1.5.chr06 14632177 6e-85
CaES2772 Pepper.v.1.5.chr06 14773392 1e-108
CaES5382 Pepper.v.1.5.chr06 16427817 2e-55
CaES4030 Pepper.v.1.5.chr06 16654207 2e-87
CaES3684 Pepper.v.1.5.chr06 18582092 1e-143
CaES2921 Pepper.v.1.5.chr06 18609672 1e-100
CaES0642 Pepper.v.1.5.chr06 20260739 1e-113
CaES2993 Pepper.v.1.5.chr06 20530536 1e-27
CaES2730 Pepper.v.1.5.chr06 20538159 5e-75
CaES5314 Pepper.v.1.5.chr06 20583193 1e-104
CaES1024 Pepper.v.1.5.chr06 20744556 9e-73
CaES3220 Pepper.v.1.5.chr06 22105265 1e-116
CaES2291 Pepper.v.1.5.chr06 25305841 1e-112
CaES4209 Pepper.v.1.5.chr06 25888521 4e-76
CaES5537 Pepper.v.1.5.chr06 28050864 3e-49
CaES5253 0.492 187 Pepper.v.1.5.chr06 34503861 8e-33
CaES1797 Pepper.v.1.5.chr06 34569867 3e-95
CaES4761 Pepper.v.1.5.chr06 35241601 6e-95
CaES5408 Pepper.v.1.5.chr06 37426106 1e-122
CaES4127 Pepper.v.1.5.chr06 37427871 1e-126
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 350


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