Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3484 Pepper.v.1.5.chr05 210095043 2e-32
CaES3494 Pepper.v.1.5.chr05 93022248 3e-38
CaES3506 Pepper.v.1.5.chr05 52897600 1e-136
CaES3525 Pepper.v.1.5.chr05 2029094 1e-107
CaES3574 Pepper.v.1.5.chr05 61622601 9e-24
CaES3606 Pepper.v.1.5.chr05 184874745 1e-128
CaES3642 Pepper.v.1.5.chr05 207682764 1e-141
CaES3668 Pepper.v.1.5.chr05 7191145 1e-135
CaES3694 Pepper.v.1.5.chr05 29471067 1e-136
CaES3714 Pepper.v.1.5.chr05 24551498 2e-63
CaES3751 Pepper.v.1.5.chr05 169801279 2e-37
CaES3833 Pepper.v.1.5.chr05 221155606 2e-47
CaES3841 Pepper.v.1.5.chr05 45425859 2e-49
CaES3893 Pepper.v.1.5.chr05 94612518 1e-134
CaES3979 Pepper.v.1.5.chr05 192128489 1e-123
CaES3990 Pepper.v.1.5.chr05 78217389 1e-122
CaES4013 Pepper.v.1.5.chr05 171433563 7e-81
CaES4044 Pepper.v.1.5.chr05 135015581 1e-118
CaES4076 Pepper.v.1.5.chr05 221203141 1e-103
CaES4118 Pepper.v.1.5.chr05 135624582 1e-90
CaES4120 Pepper.v.1.5.chr05 210387729 1e-100
CaES4147 Pepper.v.1.5.chr05 13389249 1e-111
CaES4161 Pepper.v.1.5.chr05 77833529 1e-119
CaES4184 Pepper.v.1.5.chr05 187980268 1e-129
CaES4196 Pepper.v.1.5.chr05 178545656 1e-109
CaES4203 Pepper.v.1.5.chr05 221313893 1e-100
CaES4241 Pepper.v.1.5.chr05 832255 7e-90
CaES4247 Pepper.v.1.5.chr05 17423209 1e-102
CaES4262 Pepper.v.1.5.chr05 5854202 1e-128
CaES4300 Pepper.v.1.5.chr05 139310310 1e-109
CaES4311 Pepper.v.1.5.chr05 13399047 1e-42
CaES4317 Pepper.v.1.5.chr05 210321480 1e-120
CaES4322 Pepper.v.1.5.chr05 187109920 8e-31
CaES4353 Pepper.v.1.5.chr05 221736307 2e-42
CaES4429 Pepper.v.1.5.chr05 126753754 1e-103
CaES4436 Pepper.v.1.5.chr05 205491062 1e-72
CaES4450 Pepper.v.1.5.chr05 159858542 1e-134
CaES4465 Pepper.v.1.5.chr05 48916921 1e-39
CaES4481 Pepper.v.1.5.chr05 141478070 5e-85
CaES4482 Pepper.v.1.5.chr05 174041422 6e-96
CaES4495 Pepper.v.1.5.chr05 45244071 1e-111
CaES4525 Pepper.v.1.5.chr05 17442919 1e-136
CaES4548 Pepper.v.1.5.chr05 101448776 1e-87
CaES4569 Pepper.v.1.5.chr05 9850593 1e-108
CaES4586 Pepper.v.1.5.chr05 192875832 1e-151
CaES4610 Pepper.v.1.5.chr05 20756865 1e-133
CaES4632 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr05 6827117 4e-47
CaES4633 Pepper.v.1.5.chr05 28399239 1e-110
CaES4667 Pepper.v.1.5.chr05 6221671 1e-116
CaES4705 Pepper.v.1.5.chr05 158615628 1e-124
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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