Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2654 Pepper.v.1.5.chr05 45242950 3e-61
CaES2668 Pepper.v.1.5.chr05 101449521 6e-38
CaES2669 Pepper.v.1.5.chr05 221289002 5e-63
CaES2685 Pepper.v.1.5.chr05 137340950 9e-89
CaES2709 Pepper.v.1.5.chr05 5582355 1e-121
CaES2712 Pepper.v.1.5.chr05 179072694 3e-69
CaES2764 Pepper.v.1.5.chr05 13209561 5e-96
CaES2779 Pepper.v.1.5.chr05 299571 1e-129
CaES2797 Pepper.v.1.5.chr05 202426683 3e-92
CaES2851 Pepper.v.1.5.chr05 134778277 1e-132
CaES2854 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr05 87125479 1e-156
CaES2860 Pepper.v.1.5.chr05 2717686 7e-72
CaES2872 Pepper.v.1.5.chr05 183879323 2e-94
CaES2909 Pepper.v.1.5.chr05 104941740 1e-113
CaES2929 Pepper.v.1.5.chr05 148925246 1e-129
CaES2939 Pepper.v.1.5.chr05 56753958 1e-110
CaES2944 Pepper.v.1.5.chr05 73241955 1e-123
CaES2954 Pepper.v.1.5.chr05 205337704 2e-98
CaES2957 Pepper.v.1.5.chr05 221030666 1e-81
CaES2966 Pepper.v.1.5.chr05 40377354 3e-88
CaES2994 Pepper.v.1.5.chr05 41610215 1e-149
CaES3007 Pepper.v.1.5.chr05 88541453 1e-107
CaES3020 Pepper.v.1.5.chr05 29472806 1e-130
CaES3049 Pepper.v.1.5.chr05 23857327 1e-143
CaES3055 Pepper.v.1.5.chr05 108981166 2e-96
CaES3067 Pepper.v.1.5.chr05 1668371 1e-109
CaES3080 Pepper.v.1.5.chr05 56418633 1e-126
CaES3125 Pepper.v.1.5.chr05 100805589 1e-122
CaES3154 Pepper.v.1.5.chr05 818396 1e-142
CaES3156 Pepper.v.1.5.chr05 221905942 1e-146
CaES3159 Pepper.v.1.5.chr05 67820253 8e-43
CaES3176 Pepper.v.1.5.chr05 222105838 5e-66
CaES3177 Pepper.v.1.5.chr05 9037660 8e-84
CaES3188 Pepper.v.1.5.chr05 115500359 1e-136
CaES3197 Pepper.v.1.5.chr05 5401032 1e-116
CaES3233 Pepper.v.1.5.chr05 54392705 1e-142
CaES3257 Pepper.v.1.5.chr05 217088330 1e-119
CaES3268 Pepper.v.1.5.chr05 214792476 1e-122
CaES3288 Pepper.v.1.5.chr05 5582538 1e-131
CaES3297 Pepper.v.1.5.chr05 174041164 1e-117
CaES3371 Pepper.v.1.5.chr05 222834091 1e-74
CaES3374 Pepper.v.1.5.chr05 166105543 1e-110
CaES3383 Pepper.v.1.5.chr05 48578252 2e-90
CaES3390 Pepper.v.1.5.chr05 142919330 7e-83
CaES3401 Pepper.v.1.5.chr05 213921220 1e-116
CaES3425 Pepper.v.1.5.chr05 22382038 1e-137
CaES3447 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr05 56401956 1e-149
CaES3466 Pepper.v.1.5.chr05 223100858 1e-103
CaES3470 Pepper.v.1.5.chr05 136886647 1e-120
CaES3481 Pepper.v.1.5.chr05 132984052 1e-125
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295

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