Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1752 Pepper.v.1.5.chr05 221410535 1e-134
CaES1756 Pepper.v.1.5.chr05 51565624 1e-109
CaES1815 Pepper.v.1.5.chr05 8354296 1e-128
CaES1839 Pepper.v.1.5.chr05 48809489 1e-110
CaES1844 Pepper.v.1.5.chr05 201095195 4e-97
CaES1849 Pepper.v.1.5.chr05 64064749 5e-36
CaES1855 Pepper.v.1.5.chr05 6328519 1e-105
CaES1857 Pepper.v.1.5.chr05 164789732 1e-106
CaES1896 Pepper.v.1.5.chr05 1685038 1e-130
CaES1910 Pepper.v.1.5.chr05 192370279 1e-122
CaES1923 Pepper.v.1.5.chr05 3310735 1e-146
CaES1939 Pepper.v.1.5.chr05 217118087 9e-97
CaES1981 Pepper.v.1.5.chr05 184064652 1e-131
CaES2002 Pepper.v.1.5.chr05 162338404 2e-93
CaES2004 Pepper.v.1.5.chr05 64065285 2e-21
CaES2010 Pepper.v.1.5.chr05 76314 1e-151
CaES2012 Pepper.v.1.5.chr05 5519532 1e-153
CaES2043 Pepper.v.1.5.chr05 1849968 1e-75
CaES2057 Pepper.v.1.5.chr05 220449758 1e-167
CaES2085 Pepper.v.1.5.chr05 9007495 1e-97
CaES2115 Pepper.v.1.5.chr05 214433700 1e-133
CaES2135 Pepper.v.1.5.chr05 372473 1e-141
CaES2184 Pepper.v.1.5.chr05 195697564 1e-100
CaES2189 Pepper.v.1.5.chr05 184874991 1e-118
CaES2209 Pepper.v.1.5.chr05 7909795 1e-101
CaES2218 Pepper.v.1.5.chr05 127748360 2e-70
CaES2258 Pepper.v.1.5.chr05 126758274 9e-96
CaES2268 Pepper.v.1.5.chr05 193670464 2e-66
CaES2307 Pepper.v.1.5.chr05 126753630 1e-143
CaES2316 Pepper.v.1.5.chr05 210284268 1e-108
CaES2332 0.476 192 Pepper.v.1.5.chr05 301256 1e-145
CaES2360 Pepper.v.1.5.chr05 527511 2e-75
CaES2363 Pepper.v.1.5.chr05 84946000 2e-40
CaES2379 Pepper.v.1.5.chr05 222105838 1e-49
CaES2384 Pepper.v.1.5.chr05 7024323 2e-46
CaES2400 Pepper.v.1.5.chr05 219194345 2e-98
CaES2408 Pepper.v.1.5.chr05 142398715 4e-21
CaES2426 Pepper.v.1.5.chr05 215975863 6e-90
CaES2451 Pepper.v.1.5.chr05 17418015 3e-57
CaES2459 Pepper.v.1.5.chr05 132953562 1e-101
CaES2462 Pepper.v.1.5.chr05 100865844 4e-73
CaES2472 Pepper.v.1.5.chr05 217939961 1e-95
CaES2491 Pepper.v.1.5.chr05 178545656 1e-39
CaES2545 Pepper.v.1.5.chr05 6849656 4e-55
CaES2562 Pepper.v.1.5.chr05 71109046 4e-85
CaES2565 Pepper.v.1.5.chr05 976567 2e-74
CaES2615 Pepper.v.1.5.chr05 11195254 5e-46
CaES2630 Pepper.v.1.5.chr05 220449723 1e-146
CaES2639 Pepper.v.1.5.chr05 208173670 6e-91
CaES2649 Pepper.v.1.5.chr05 13454192 1e-122
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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