Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0905 Pepper.v.1.5.chr05 128239986 1e-138
CaES0906 Pepper.v.1.5.chr05 209031616 1e-105
CaES0914 Pepper.v.1.5.chr05 1681561 1e-120
CaES0935 Pepper.v.1.5.chr05 28237099 6e-47
CaES0960 Pepper.v.1.5.chr05 29471628 8e-27
CaES0965 Pepper.v.1.5.chr05 208445528 1e-120
CaES0975 Pepper.v.1.5.chr05 192871506 3e-50
CaES0994 Pepper.v.1.5.chr05 172482552 1e-107
CaES1009 Pepper.v.1.5.chr05 72670250 2e-46
CaES1020 Pepper.v.1.5.chr05 29911072 7e-57
CaES1060 Pepper.v.1.5.chr05 32155015 4e-39
CaES1074 Pepper.v.1.5.chr05 157284078 1e-135
CaES1079 Pepper.v.1.5.chr05 6684820 2e-45
CaES1106 Pepper.v.1.5.chr05 24247441 1e-130
CaES1149 Pepper.v.1.5.chr05 221894809 3e-80
CaES1150 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 1e-103
CaES1167 Pepper.v.1.5.chr05 186543087 1e-132
CaES1230 Pepper.v.1.5.chr05 23689330 5e-53
CaES1248 Pepper.v.1.5.chr05 207247204 3e-41
CaES1266 Pepper.v.1.5.chr05 223078508 7e-89
CaES1286 Pepper.v.1.5.chr05 2333414 1e-126
CaES1305 Pepper.v.1.5.chr05 48916921 1e-39
CaES1308 Pepper.v.1.5.chr05 66826218 1e-131
CaES1330 Pepper.v.1.5.chr05 28261873 1e-121
CaES1358 Pepper.v.1.5.chr05 2290037 1e-145
CaES1374 Pepper.v.1.5.chr05 137053941 1e-144
CaES1379 Pepper.v.1.5.chr05 110201537 1e-84
CaES1396 Pepper.v.1.5.chr05 221391297 1e-119
CaES1399 Pepper.v.1.5.chr05 40696572 1e-86
CaES1400 Pepper.v.1.5.chr05 205334948 1e-122
CaES1402 Pepper.v.1.5.chr05 126157308 1e-131
CaES1436 Pepper.v.1.5.chr05 25303544 1e-139
CaES1454 Pepper.v.1.5.chr05 169807490 8e-95
CaES1486 Pepper.v.1.5.chr05 210238317 1e-146
CaES1498 Pepper.v.1.5.chr05 120176710 4e-37
CaES1510 Pepper.v.1.5.chr05 221194283 1e-74
CaES1526 Pepper.v.1.5.chr05 210368514 8e-49
CaES1534 Pepper.v.1.5.chr05 198913494 2e-74
CaES1546 Pepper.v.1.5.chr05 133818379 1e-47
CaES1608 Pepper.v.1.5.chr05 221197622 1e-45
CaES1627 Pepper.v.1.5.chr05 26556034 3e-96
CaES1629 Pepper.v.1.5.chr05 26558002 1e-103
CaES1654 Pepper.v.1.5.chr05 184119540 2e-32
CaES1676 Pepper.v.1.5.chr05 4766101 1e-100
CaES1708 Pepper.v.1.5.chr05 78662807 1e-118
CaES1709 Pepper.v.1.5.chr05 766544 4e-70
CaES1712 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 1e-83
CaES1731 Pepper.v.1.5.chr05 17442170 7e-80
CaES1733 Pepper.v.1.5.chr05 37482094 5e-59
CaES1741 Pepper.v.1.5.chr05 378706 9e-66
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295

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