Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0026 Pepper.v.1.5.chr04 16149411 2e-81
CaES0070 Pepper.v.1.5.chr04 62371350 3e-28
CaES0071 Pepper.v.1.5.chr04 9019843 1e-112
CaES0076 Pepper.v.1.5.chr04 55936766 8e-55
CaES0105 Pepper.v.1.5.chr04 476356 1e-136
CaES0136 Pepper.v.1.5.chr04 196820469 3e-96
CaES0152 Pepper.v.1.5.chr04 12213030 2e-39
CaES0188 Pepper.v.1.5.chr04 200472243 1e-105
CaES0210 Pepper.v.1.5.chr04 49455559 1e-121
CaES0229 Pepper.v.1.5.chr04 168014259 1e-117
CaES0242 Pepper.v.1.5.chr04 176991647 6e-69
CaES0325 Pepper.v.1.5.chr04 70699534 2e-58
CaES0341 Pepper.v.1.5.chr04 202094110 1e-114
CaES0348 Pepper.v.1.5.chr04 22266111 1e-22
CaES0359 Pepper.v.1.5.chr04 8779776 1e-104
CaES0382 Pepper.v.1.5.chr04 198849423 1e-133
CaES0388 Pepper.v.1.5.chr04 17579103 1e-131
CaES0390 Pepper.v.1.5.chr04 201495017 6e-95
CaES0396 Pepper.v.1.5.chr04 19104331 1e-138
CaES0427 Pepper.v.1.5.chr04 197594939 1e-119
CaES0436 Pepper.v.1.5.chr04 120765593 1e-122
CaES0447 Pepper.v.1.5.chr04 201957121 1e-109
CaES0456 Pepper.v.1.5.chr04 51667364 3e-47
CaES0484 Pepper.v.1.5.chr04 113122904 8e-24
CaES0487 Pepper.v.1.5.chr04 103235809 6e-57
CaES0512 Pepper.v.1.5.chr04 169327430 3e-31
CaES0519 Pepper.v.1.5.chr04 201965404 1e-109
CaES0520 Pepper.v.1.5.chr04 195419810 9e-61
CaES0648 Pepper.v.1.5.chr04 200983148 1e-125
CaES0654 Pepper.v.1.5.chr04 62371881 1e-116
CaES0686 Pepper.v.1.5.chr04 60754894 3e-89
CaES0693 Pepper.v.1.5.chr04 9379498 1e-118
CaES0706 Pepper.v.1.5.chr04 21127038 2e-22
CaES0721 Pepper.v.1.5.chr04 167902602 1e-108
CaES0745 Pepper.v.1.5.chr04 116890914 8e-95
CaES0779 Pepper.v.1.5.chr04 21118279 8e-79
CaES0793 Pepper.v.1.5.chr04 167818663 2e-81
CaES0795 Pepper.v.1.5.chr04 167982804 7e-77
CaES0831 Pepper.v.1.5.chr04 197605273 7e-76
CaES0834 Pepper.v.1.5.chr04 205063853 6e-88
CaES0841 Pepper.v.1.5.chr04 126185412 7e-78
CaES0849 Pepper.v.1.5.chr04 21347712 1e-118
CaES0893 Pepper.v.1.5.chr04 109903592 1e-135
CaES0912 Pepper.v.1.5.chr04 31780303 2e-89
CaES0917 Pepper.v.1.5.chr04 83742534 1e-116
CaES0918 Pepper.v.1.5.chr04 94966012 1e-25
CaES0919 Pepper.v.1.5.chr04 32844624 3e-39
CaES0956 Pepper.v.1.5.chr04 206307956 4e-68
CaES0958 Pepper.v.1.5.chr04 59108242 1e-122
CaES0968 Pepper.v.1.5.chr04 142193597 6e-36
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307

MarkerDB | Capsicum annuum