Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4780 Pepper.v.1.5.chr04 76614601 5e-64
CaES4817 Pepper.v.1.5.chr04 198830087 1e-140
CaES4822 Pepper.v.1.5.chr04 196783053 1e-138
CaES4823 Pepper.v.1.5.chr04 191434016 4e-53
CaES4840 Pepper.v.1.5.chr04 49222340 1e-138
CaES4863 Pepper.v.1.5.chr04 205142192 1e-131
CaES4866 Pepper.v.1.5.chr04 163291625 1e-90
CaES4880 Pepper.v.1.5.chr04 92269901 1e-151
CaES4890 Pepper.v.1.5.chr04 123461777 3e-93
CaES4921 Pepper.v.1.5.chr04 205007724 2e-57
CaES4934 Pepper.v.1.5.chr04 35681770 1e-135
CaES4952 Pepper.v.1.5.chr04 88816037 6e-91
CaES4989 Pepper.v.1.5.chr04 14130488 1e-125
CaES4992 Pepper.v.1.5.chr04 204763087 4e-62
CaES5022 Pepper.v.1.5.chr04 138512677 1e-146
CaES5026 Pepper.v.1.5.chr04 8608712 1e-143
CaES5029 Pepper.v.1.5.chr04 205666777 2e-33
CaES5050 Pepper.v.1.5.chr04 15032137 1e-134
CaES5057 Pepper.v.1.5.chr04 183614008 1e-106
CaES5062 Pepper.v.1.5.chr04 142876552 1e-108
CaES5063 Pepper.v.1.5.chr04 191236052 1e-125
CaES5068 Pepper.v.1.5.chr04 205681308 8e-80
CaES5089 Pepper.v.1.5.chr04 73700869 1e-128
CaES5102 Pepper.v.1.5.chr04 189357531 5e-85
CaES5112 Pepper.v.1.5.chr04 202522709 9e-91
CaES5124 Pepper.v.1.5.chr04 95556255 1e-87
CaES5126 Pepper.v.1.5.chr04 202522709 1e-113
CaES5130 Pepper.v.1.5.chr04 201535194 1e-155
CaES5135 Pepper.v.1.5.chr04 200985539 1e-115
CaES5140 Pepper.v.1.5.chr04 6257899 1e-126
CaES5144 Pepper.v.1.5.chr04 113164663 1e-85
CaES5170 Pepper.v.1.5.chr04 184627880 1e-64
CaES5173 Pepper.v.1.5.chr04 175259107 1e-133
CaES5183 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 33755400 1e-152
CaES5188 Pepper.v.1.5.chr04 172299049 2e-21
CaES5252 Pepper.v.1.5.chr04 149066988 1e-89
CaES5255 Pepper.v.1.5.chr04 109661928 9e-79
CaES5257 Pepper.v.1.5.chr04 197390970 2e-41
CaES5277 Pepper.v.1.5.chr04 79216728 2e-85
CaES5322 Pepper.v.1.5.chr04 103633306 1e-93
CaES5337 Pepper.v.1.5.chr04 193634196 1e-106
CaES5362 Pepper.v.1.5.chr04 124626089 1e-127
CaES5410 Pepper.v.1.5.chr04 184199264 5e-34
CaES5417 Pepper.v.1.5.chr04 19976296 4e-33
CaES5422 Pepper.v.1.5.chr04 39931805 2e-27
CaES5425 Pepper.v.1.5.chr04 61091666 6e-50
CaES5452 Pepper.v.1.5.chr04 12623071 6e-40
CaES5475 Pepper.v.1.5.chr04 205148244 4e-54
CaES5480 Pepper.v.1.5.chr04 198850075 3e-50
CaES5502 Pepper.v.1.5.chr04 160272604 7e-91
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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