Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES3651 Pepper.v.1.5.chr04 80933155 1e-41
CaES3680 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr04 176290308 4e-95
CaES3716 Pepper.v.1.5.chr04 8807650 4e-53
CaES3726 Pepper.v.1.5.chr04 200416905 5e-90
CaES3740 Pepper.v.1.5.chr04 92270661 1e-135
CaES3742 Pepper.v.1.5.chr04 204812114 1e-106
CaES3752 Pepper.v.1.5.chr04 201147951 9e-57
CaES3781 Pepper.v.1.5.chr04 14686088 2e-40
CaES3860 Pepper.v.1.5.chr04 158820686 1e-115
CaES3901 Pepper.v.1.5.chr04 185110938 1e-110
CaES3902 Pepper.v.1.5.chr04 70696883 1e-125
CaES3921 Pepper.v.1.5.chr04 204493044 2e-83
CaES3925 Pepper.v.1.5.chr04 174230316 1e-139
CaES3943 Pepper.v.1.5.chr04 187922001 5e-88
CaES3946 Pepper.v.1.5.chr04 174852799 1e-121
CaES3951 Pepper.v.1.5.chr04 189456688 1e-113
CaES3981 Pepper.v.1.5.chr04 89185703 1e-113
CaES4018 Pepper.v.1.5.chr04 204662815 1e-129
CaES4019 Pepper.v.1.5.chr04 205787997 5e-97
CaES4022 Pepper.v.1.5.chr04 21347763 6e-39
CaES4041 Pepper.v.1.5.chr04 197391894 1e-113
CaES4080 Pepper.v.1.5.chr04 203676486 1e-137
CaES4090 Pepper.v.1.5.chr04 197944318 1e-155
CaES4108 Pepper.v.1.5.chr04 127410987 1e-132
CaES4157 Pepper.v.1.5.chr04 24859174 2e-41
CaES4165 Pepper.v.1.5.chr04 12716884 1e-152
CaES4176 Pepper.v.1.5.chr04 14747025 7e-68
CaES4178 Pepper.v.1.5.chr04 47281596 1e-138
CaES4180 Pepper.v.1.5.chr04 15611266 1e-121
CaES4230 Pepper.v.1.5.chr04 201483871 1e-135
CaES4258 Pepper.v.1.5.chr04 205141996 1e-126
CaES4283 Pepper.v.1.5.chr04 100024829 1e-86
CaES4285 Pepper.v.1.5.chr04 19971393 1e-104
CaES4330 Pepper.v.1.5.chr04 191518841 1e-134
CaES4371 Pepper.v.1.5.chr04 196984377 1e-91
CaES4419 Pepper.v.1.5.chr04 151109580 2e-59
CaES4426 Pepper.v.1.5.chr04 16426873 1e-73
CaES4513 Pepper.v.1.5.chr04 37861870 1e-74
CaES4604 Pepper.v.1.5.chr04 127181106 1e-117
CaES4607 Pepper.v.1.5.chr04 6376644 9e-75
CaES4627 Pepper.v.1.5.chr04 80934656 1e-104
CaES4649 Pepper.v.1.5.chr04 96610290 2e-69
CaES4709 Pepper.v.1.5.chr04 13228092 3e-39
CaES4720 Pepper.v.1.5.chr04 152172710 1e-69
CaES4725 Pepper.v.1.5.chr04 149066587 2e-90
CaES4735 Pepper.v.1.5.chr04 5780176 1e-108
CaES4741 Pepper.v.1.5.chr04 11495109 4e-77
CaES4760 Pepper.v.1.5.chr04 159454204 1e-166
CaES4764 Pepper.v.1.5.chr04 150072491 1e-89
CaES4778 Pepper.v.1.5.chr04 61086305 1e-116
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307

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