Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1870 Pepper.v.1.5.chr04 183739197 1e-116
CaES5410 Pepper.v.1.5.chr04 184199264 5e-34
CaES1344 Pepper.v.1.5.chr04 184238196 2e-35
CaES5170 Pepper.v.1.5.chr04 184627880 1e-64
CaES3901 Pepper.v.1.5.chr04 185110938 1e-110
CaES2201 Pepper.v.1.5.chr04 185513018 1e-106
CaES3535 Pepper.v.1.5.chr04 185513686 2e-95
CaES1979 Pepper.v.1.5.chr04 186782167 1e-127
CaES3943 Pepper.v.1.5.chr04 187922001 5e-88
CaES2045 Pepper.v.1.5.chr04 188559823 1e-103
CaES5102 Pepper.v.1.5.chr04 189357531 5e-85
CaES2635 Pepper.v.1.5.chr04 189456356 1e-22
CaES3951 Pepper.v.1.5.chr04 189456688 1e-113
CaES1616 Pepper.v.1.5.chr04 189844588 2e-88
CaES5063 Pepper.v.1.5.chr04 191236052 1e-125
CaES4823 Pepper.v.1.5.chr04 191434016 4e-53
CaES3274 Pepper.v.1.5.chr04 191508643 3e-62
CaES4330 Pepper.v.1.5.chr04 191518841 1e-134
CaES2113 Pepper.v.1.5.chr04 192590355 2e-97
CaES3320 Pepper.v.1.5.chr04 193559681 4e-59
CaES5337 Pepper.v.1.5.chr04 193634196 1e-106
CaES1775 Pepper.v.1.5.chr04 193739926 1e-39
CaES0520 Pepper.v.1.5.chr04 195419810 9e-61
CaES3155 Pepper.v.1.5.chr04 195726954 1e-147
CaES4822 Pepper.v.1.5.chr04 196783053 1e-138
CaES1166 Pepper.v.1.5.chr04 196797144 1e-124
CaES0136 Pepper.v.1.5.chr04 196820469 3e-96
CaES4371 Pepper.v.1.5.chr04 196984377 1e-91
CaES5599 Pepper.v.1.5.chr04 197352611 1e-81
CaES1890 Pepper.v.1.5.chr04 197354863 3e-69
CaES5257 Pepper.v.1.5.chr04 197390970 2e-41
CaES4041 Pepper.v.1.5.chr04 197391894 1e-113
CaES0427 Pepper.v.1.5.chr04 197594939 1e-119
CaES0831 Pepper.v.1.5.chr04 197605273 7e-76
CaES1897 Pepper.v.1.5.chr04 197633082 4e-43
CaES1179 Pepper.v.1.5.chr04 197938870 7e-28
CaES4090 Pepper.v.1.5.chr04 197944318 1e-155
CaES2488 Pepper.v.1.5.chr04 198066430 1e-100
CaES1210 Pepper.v.1.5.chr04 198796066 1e-114
CaES4817 Pepper.v.1.5.chr04 198830087 1e-140
CaES0382 Pepper.v.1.5.chr04 198849423 1e-133
CaES5480 Pepper.v.1.5.chr04 198850075 3e-50
CaES1886 Pepper.v.1.5.chr04 198852008 2e-35
CaES3726 Pepper.v.1.5.chr04 200416905 5e-90
CaES0188 Pepper.v.1.5.chr04 200472243 1e-105
CaES0648 Pepper.v.1.5.chr04 200983148 1e-125
CaES5135 Pepper.v.1.5.chr04 200985539 1e-115
CaES3752 Pepper.v.1.5.chr04 201147951 9e-57
CaES2821 Pepper.v.1.5.chr04 201228339 1e-76
CaES4230 Pepper.v.1.5.chr04 201483871 1e-135
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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