Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0436 Pepper.v.1.5.chr04 120765593 1e-122
CaES2401 Pepper.v.1.5.chr04 120815876 2e-33
CaES4890 Pepper.v.1.5.chr04 123461777 3e-93
CaES5362 Pepper.v.1.5.chr04 124626089 1e-127
CaES2387 Pepper.v.1.5.chr04 125864339 5e-50
CaES0841 Pepper.v.1.5.chr04 126185412 7e-78
CaES4604 Pepper.v.1.5.chr04 127181106 1e-117
CaES4108 Pepper.v.1.5.chr04 127410987 1e-132
CaES5022 Pepper.v.1.5.chr04 138512677 1e-146
CaES2022 Pepper.v.1.5.chr04 140163580 4e-69
CaES3003 Pepper.v.1.5.chr04 140163868 3e-88
CaES1375 Pepper.v.1.5.chr04 141154490 2e-43
CaES0968 Pepper.v.1.5.chr04 142193597 6e-36
CaES5062 Pepper.v.1.5.chr04 142876552 1e-108
CaES1670 Pepper.v.1.5.chr04 147254073 2e-54
CaES2140 Pepper.v.1.5.chr04 147254073 1e-102
CaES4725 Pepper.v.1.5.chr04 149066587 2e-90
CaES5252 Pepper.v.1.5.chr04 149066988 1e-89
CaES2682 Pepper.v.1.5.chr04 149672045 3e-90
CaES4764 Pepper.v.1.5.chr04 150072491 1e-89
CaES2619 Pepper.v.1.5.chr04 150711936 1e-138
CaES1334 Pepper.v.1.5.chr04 151109276 6e-24
CaES4419 Pepper.v.1.5.chr04 151109580 2e-59
CaES4720 Pepper.v.1.5.chr04 152172710 1e-69
CaES3860 Pepper.v.1.5.chr04 158820686 1e-115
CaES4760 Pepper.v.1.5.chr04 159454204 1e-166
CaES5502 Pepper.v.1.5.chr04 160272604 7e-91
CaES1805 Pepper.v.1.5.chr04 161282397 1e-105
CaES2121 Pepper.v.1.5.chr04 161316039 3e-59
CaES4866 Pepper.v.1.5.chr04 163291625 1e-90
CaES1901 Pepper.v.1.5.chr04 167767682 7e-31
CaES0793 Pepper.v.1.5.chr04 167818663 2e-81
CaES0721 Pepper.v.1.5.chr04 167902602 1e-108
CaES0795 Pepper.v.1.5.chr04 167982804 7e-77
CaES0229 Pepper.v.1.5.chr04 168014259 1e-117
CaES1448 Pepper.v.1.5.chr04 169272333 1e-122
CaES0512 Pepper.v.1.5.chr04 169327430 3e-31
CaES2913 Pepper.v.1.5.chr04 169665468 1e-98
CaES5188 Pepper.v.1.5.chr04 172299049 2e-21
CaES1078 Pepper.v.1.5.chr04 172309338 1e-67
CaES3925 Pepper.v.1.5.chr04 174230316 1e-139
CaES1622 Pepper.v.1.5.chr04 174488294 1e-122
CaES3946 Pepper.v.1.5.chr04 174852799 1e-121
CaES5173 Pepper.v.1.5.chr04 175259107 1e-133
CaES3498 Pepper.v.1.5.chr04 175588141 8e-64
CaES2120 Pepper.v.1.5.chr04 175671752 1e-135
CaES0242 Pepper.v.1.5.chr04 176991647 6e-69
CaES2956 Pepper.v.1.5.chr04 177347268 5e-83
CaES2984 Pepper.v.1.5.chr04 182944371 1e-108
CaES1409 Pepper.v.1.5.chr04 183218189 3e-75
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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