Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2746 Pepper.v.1.5.chr04 27045464 1e-90
CaES2755 Pepper.v.1.5.chr04 13704146 2e-57
CaES2767 Pepper.v.1.5.chr04 53125815 1e-106
CaES2782 Pepper.v.1.5.chr04 201516929 1e-153
CaES2785 Pepper.v.1.5.chr04 20170519 1e-113
CaES2793 Pepper.v.1.5.chr04 102479596 1e-141
CaES2800 Pepper.v.1.5.chr04 31550159 1e-83
CaES2821 Pepper.v.1.5.chr04 201228339 1e-76
CaES2826 Pepper.v.1.5.chr04 205026459 5e-64
CaES2843 Pepper.v.1.5.chr04 80925891 2e-23
CaES2881 Pepper.v.1.5.chr04 204951238 2e-32
CaES2913 Pepper.v.1.5.chr04 169665468 1e-98
CaES2918 Pepper.v.1.5.chr04 6376635 2e-94
CaES2956 Pepper.v.1.5.chr04 177347268 5e-83
CaES2984 Pepper.v.1.5.chr04 182944371 1e-108
CaES2992 Pepper.v.1.5.chr04 311569 1e-117
CaES3000 Pepper.v.1.5.chr04 117617070 1e-136
CaES3003 Pepper.v.1.5.chr04 140163868 3e-88
CaES3084 Pepper.v.1.5.chr04 95555572 1e-102
CaES3114 Pepper.v.1.5.chr04 204266796 4e-36
CaES3133 Pepper.v.1.5.chr04 6197765 1e-116
CaES3155 Pepper.v.1.5.chr04 195726954 1e-147
CaES3209 Pepper.v.1.5.chr04 117335843 1e-121
CaES3216 Pepper.v.1.5.chr04 202734089 3e-34
CaES3245 Pepper.v.1.5.chr04 73843698 3e-75
CaES3248 Pepper.v.1.5.chr04 101608595 1e-106
CaES3274 Pepper.v.1.5.chr04 191508643 3e-62
CaES3320 Pepper.v.1.5.chr04 193559681 4e-59
CaES3337 Pepper.v.1.5.chr04 9372997 2e-82
CaES3346 Pepper.v.1.5.chr04 37542369 1e-25
CaES3399 Pepper.v.1.5.chr04 7303654 5e-38
CaES3402 Pepper.v.1.5.chr04 69523831 4e-33
CaES3430 Pepper.v.1.5.chr04 205368820 1e-135
CaES3437 Pepper.v.1.5.chr04 205563491 1e-144
CaES3440 Pepper.v.1.5.chr04 80851336 1e-121
CaES3451 Pepper.v.1.5.chr04 5941767 1e-138
CaES3455 Pepper.v.1.5.chr04 204693017 1e-126
CaES3491 Pepper.v.1.5.chr04 82611861 7e-49
CaES3498 Pepper.v.1.5.chr04 175588141 8e-64
CaES3524 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 205666777 1e-23
CaES3531 Pepper.v.1.5.chr04 14890244 1e-117
CaES3532 Pepper.v.1.5.chr04 119533962 2e-79
CaES3535 Pepper.v.1.5.chr04 185513686 2e-95
CaES3550 Pepper.v.1.5.chr04 10189652 1e-111
CaES3582 Pepper.v.1.5.chr04 201536029 6e-62
CaES3590 Pepper.v.1.5.chr04 105717664 1e-113
CaES3620 Pepper.v.1.5.chr04 110059780 1e-133
CaES3624 Pepper.v.1.5.chr04 25445098 9e-59
CaES3626 Pepper.v.1.5.chr04 203288593 3e-98
CaES3644 Pepper.v.1.5.chr04 203689176 1e-147
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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