Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0070 Pepper.v.1.5.chr04 62371350 3e-28
CaES0654 Pepper.v.1.5.chr04 62371881 1e-116
CaES3402 Pepper.v.1.5.chr04 69523831 4e-33
CaES3902 Pepper.v.1.5.chr04 70696883 1e-125
CaES0325 Pepper.v.1.5.chr04 70699534 2e-58
CaES5089 Pepper.v.1.5.chr04 73700869 1e-128
CaES3245 Pepper.v.1.5.chr04 73843698 3e-75
CaES2676 Pepper.v.1.5.chr04 73844467 1e-139
CaES4780 Pepper.v.1.5.chr04 76614601 5e-64
CaES1156 Pepper.v.1.5.chr04 76809894 7e-41
CaES5277 Pepper.v.1.5.chr04 79216728 2e-85
CaES3440 Pepper.v.1.5.chr04 80851336 1e-121
CaES2843 Pepper.v.1.5.chr04 80925891 2e-23
CaES3651 Pepper.v.1.5.chr04 80933155 1e-41
CaES4627 Pepper.v.1.5.chr04 80934656 1e-104
CaES2318 Pepper.v.1.5.chr04 82505752 1e-62
CaES3491 Pepper.v.1.5.chr04 82611861 7e-49
CaES0917 Pepper.v.1.5.chr04 83742534 1e-116
CaES2543 Pepper.v.1.5.chr04 88553298 4e-39
CaES4952 Pepper.v.1.5.chr04 88816037 6e-91
CaES3981 Pepper.v.1.5.chr04 89185703 1e-113
CaES4880 Pepper.v.1.5.chr04 92269901 1e-151
CaES3740 Pepper.v.1.5.chr04 92270661 1e-135
CaES1991 Pepper.v.1.5.chr04 93123856 1e-123
CaES0918 Pepper.v.1.5.chr04 94966012 1e-25
CaES2187 Pepper.v.1.5.chr04 95554666 1e-140
CaES3084 Pepper.v.1.5.chr04 95555572 1e-102
CaES5124 Pepper.v.1.5.chr04 95556255 1e-87
CaES4649 Pepper.v.1.5.chr04 96610290 2e-69
CaES2251 Pepper.v.1.5.chr04 98355941 7e-37
CaES4283 Pepper.v.1.5.chr04 100024829 1e-86
CaES3248 Pepper.v.1.5.chr04 101608595 1e-106
CaES2793 Pepper.v.1.5.chr04 102479596 1e-141
CaES0487 Pepper.v.1.5.chr04 103235809 6e-57
CaES5322 Pepper.v.1.5.chr04 103633306 1e-93
CaES1260 Pepper.v.1.5.chr04 103644475 2e-47
CaES3590 Pepper.v.1.5.chr04 105717664 1e-113
CaES1423 Pepper.v.1.5.chr04 106192111 3e-54
CaES5255 Pepper.v.1.5.chr04 109661928 9e-79
CaES1972 Pepper.v.1.5.chr04 109838920 7e-90
CaES2431 Pepper.v.1.5.chr04 109840309 1e-115
CaES0893 Pepper.v.1.5.chr04 109903592 1e-135
CaES3620 Pepper.v.1.5.chr04 110059780 1e-133
CaES0484 Pepper.v.1.5.chr04 113122904 8e-24
CaES5144 Pepper.v.1.5.chr04 113164663 1e-85
CaES2728 Pepper.v.1.5.chr04 113510893 2e-40
CaES0745 Pepper.v.1.5.chr04 116890914 8e-95
CaES3209 Pepper.v.1.5.chr04 117335843 1e-121
CaES3000 Pepper.v.1.5.chr04 117617070 1e-136
CaES3532 Pepper.v.1.5.chr04 119533962 2e-79
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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