Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES3531 Pepper.v.1.5.chr04 14890244 1e-117
CaES1779 Pepper.v.1.5.chr04 14978831 2e-94
CaES5050 Pepper.v.1.5.chr04 15032137 1e-134
CaES1256 Pepper.v.1.5.chr04 15185889 1e-122
CaES4180 Pepper.v.1.5.chr04 15611266 1e-121
CaES0026 Pepper.v.1.5.chr04 16149411 2e-81
CaES4426 Pepper.v.1.5.chr04 16426873 1e-73
CaES0388 Pepper.v.1.5.chr04 17579103 1e-131
CaES0396 Pepper.v.1.5.chr04 19104331 1e-138
CaES4285 Pepper.v.1.5.chr04 19971393 1e-104
CaES5417 Pepper.v.1.5.chr04 19976296 4e-33
CaES2785 Pepper.v.1.5.chr04 20170519 1e-113
CaES0779 Pepper.v.1.5.chr04 21118279 8e-79
CaES0706 Pepper.v.1.5.chr04 21127038 2e-22
CaES0849 Pepper.v.1.5.chr04 21347712 1e-118
CaES4022 Pepper.v.1.5.chr04 21347763 6e-39
CaES1600 Pepper.v.1.5.chr04 21349856 3e-43
CaES0348 Pepper.v.1.5.chr04 22266111 1e-22
CaES1451 Pepper.v.1.5.chr04 22911950 1e-115
CaES4157 Pepper.v.1.5.chr04 24859174 2e-41
CaES3624 Pepper.v.1.5.chr04 25445098 9e-59
CaES2746 Pepper.v.1.5.chr04 27045464 1e-90
CaES2800 Pepper.v.1.5.chr04 31550159 1e-83
CaES0912 Pepper.v.1.5.chr04 31780303 2e-89
CaES0919 Pepper.v.1.5.chr04 32844624 3e-39
CaES4934 Pepper.v.1.5.chr04 35681770 1e-135
CaES3346 Pepper.v.1.5.chr04 37542369 1e-25
CaES4513 Pepper.v.1.5.chr04 37861870 1e-74
CaES1656 Pepper.v.1.5.chr04 38073674 3e-22
CaES5422 Pepper.v.1.5.chr04 39931805 2e-27
CaES2129 Pepper.v.1.5.chr04 41270732 1e-120
CaES2242 Pepper.v.1.5.chr04 41846148 1e-141
CaES1874 Pepper.v.1.5.chr04 42866446 3e-80
CaES2612 Pepper.v.1.5.chr04 44209850 1e-132
CaES1314 Pepper.v.1.5.chr04 45109256 1e-125
CaES4178 Pepper.v.1.5.chr04 47281596 1e-138
CaES1089 Pepper.v.1.5.chr04 48687115 4e-48
CaES4840 Pepper.v.1.5.chr04 49222340 1e-138
CaES0210 Pepper.v.1.5.chr04 49455559 1e-121
CaES5538 Pepper.v.1.5.chr04 51294979 3e-89
CaES0456 Pepper.v.1.5.chr04 51667364 3e-47
CaES2767 Pepper.v.1.5.chr04 53125815 1e-106
CaES0076 Pepper.v.1.5.chr04 55936766 8e-55
CaES2428 Pepper.v.1.5.chr04 57309616 1e-134
CaES1408 Pepper.v.1.5.chr04 57659554 1e-126
CaES2590 Pepper.v.1.5.chr04 59107903 1e-112
CaES0958 Pepper.v.1.5.chr04 59108242 1e-122
CaES0686 Pepper.v.1.5.chr04 60754894 3e-89
CaES4778 Pepper.v.1.5.chr04 61086305 1e-116
CaES5425 Pepper.v.1.5.chr04 61091666 6e-50
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307

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