Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1052 Pepper.v.1.5.chr04 8772867 1e-70
CaES1078 Pepper.v.1.5.chr04 172309338 1e-67
CaES1080 Pepper.v.1.5.chr04 206149483 2e-23
CaES1089 Pepper.v.1.5.chr04 48687115 4e-48
CaES1091 Pepper.v.1.5.chr04 8582658 1e-117
CaES1156 Pepper.v.1.5.chr04 76809894 7e-41
CaES1166 Pepper.v.1.5.chr04 196797144 1e-124
CaES1179 Pepper.v.1.5.chr04 197938870 7e-28
CaES1210 Pepper.v.1.5.chr04 198796066 1e-114
CaES1256 Pepper.v.1.5.chr04 15185889 1e-122
CaES1260 Pepper.v.1.5.chr04 103644475 2e-47
CaES1271 Pepper.v.1.5.chr04 6980604 1e-30
CaES1272 Pepper.v.1.5.chr04 12854182 2e-63
CaES1310 Pepper.v.1.5.chr04 204837173 1e-124
CaES1314 Pepper.v.1.5.chr04 45109256 1e-125
CaES1334 Pepper.v.1.5.chr04 151109276 6e-24
CaES1344 Pepper.v.1.5.chr04 184238196 2e-35
CaES1367 Pepper.v.1.5.chr04 203743942 7e-87
CaES1375 Pepper.v.1.5.chr04 141154490 2e-43
CaES1408 Pepper.v.1.5.chr04 57659554 1e-126
CaES1409 Pepper.v.1.5.chr04 183218189 3e-75
CaES1423 Pepper.v.1.5.chr04 106192111 3e-54
CaES1433 Pepper.v.1.5.chr04 13411640 1e-123
CaES1448 Pepper.v.1.5.chr04 169272333 1e-122
CaES1451 Pepper.v.1.5.chr04 22911950 1e-115
CaES1505 Pepper.v.1.5.chr04 202638552 1e-80
CaES1600 Pepper.v.1.5.chr04 21349856 3e-43
CaES1613 Pepper.v.1.5.chr04 6133173 7e-71
CaES1616 Pepper.v.1.5.chr04 189844588 2e-88
CaES1622 Pepper.v.1.5.chr04 174488294 1e-122
CaES1645 Pepper.v.1.5.chr04 204958872 9e-89
CaES1656 Pepper.v.1.5.chr04 38073674 3e-22
CaES1670 Pepper.v.1.5.chr04 147254073 2e-54
CaES1694 Pepper.v.1.5.chr04 202543057 1e-121
CaES1775 Pepper.v.1.5.chr04 193739926 1e-39
CaES1779 Pepper.v.1.5.chr04 14978831 2e-94
CaES1805 Pepper.v.1.5.chr04 161282397 1e-105
CaES1825 Pepper.v.1.5.chr04 203736146 5e-64
CaES1870 Pepper.v.1.5.chr04 183739197 1e-116
CaES1874 Pepper.v.1.5.chr04 42866446 3e-80
CaES1886 Pepper.v.1.5.chr04 198852008 2e-35
CaES1890 Pepper.v.1.5.chr04 197354863 3e-69
CaES1897 Pepper.v.1.5.chr04 197633082 4e-43
CaES1901 Pepper.v.1.5.chr04 167767682 7e-31
CaES1905 Pepper.v.1.5.chr04 205369040 3e-56
CaES1947 Pepper.v.1.5.chr04 206110724 1e-138
CaES1948 Pepper.v.1.5.chr04 202712337 6e-88
CaES1953 Pepper.v.1.5.chr04 203612036 3e-97
CaES1972 Pepper.v.1.5.chr04 109838920 7e-90
CaES1979 Pepper.v.1.5.chr04 186782167 1e-127
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307

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