Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4130 Pepper.v.1.5.chr03 14953670 3e-30
CaES4131 Pepper.v.1.5.chr03 237763350 1e-151
CaES4142 Pepper.v.1.5.chr03 234801149 1e-121
CaES4149 Pepper.v.1.5.chr03 213286901 1e-101
CaES4168 Pepper.v.1.5.chr03 236146667 5e-76
CaES4175 Pepper.v.1.5.chr03 8050985 2e-99
CaES4177 Pepper.v.1.5.chr03 214056540 1e-100
CaES4179 Pepper.v.1.5.chr03 235434655 4e-46
CaES4193 Pepper.v.1.5.chr03 2888162 3e-24
CaES4200 Pepper.v.1.5.chr03 239293078 1e-100
CaES4231 Pepper.v.1.5.chr03 1745137 8e-85
CaES4232 Pepper.v.1.5.chr03 236845752 1e-121
CaES4233 Pepper.v.1.5.chr03 137733004 1e-81
CaES4278 Pepper.v.1.5.chr03 7280732 1e-106
CaES4282 Pepper.v.1.5.chr03 21077825 2e-93
CaES4288 Pepper.v.1.5.chr03 238261760 1e-117
CaES4301 Pepper.v.1.5.chr03 147244350 3e-99
CaES4323 Pepper.v.1.5.chr03 223573604 1e-130
CaES4327 Pepper.v.1.5.chr03 26140626 3e-37
CaES4341 Pepper.v.1.5.chr03 17787450 3e-72
CaES4348 Pepper.v.1.5.chr03 175161288 1e-131
CaES4359 Pepper.v.1.5.chr03 74997836 3e-77
CaES4365 Pepper.v.1.5.chr03 214870193 1e-133
CaES4369 Pepper.v.1.5.chr03 21147177 1e-137
CaES4373 Pepper.v.1.5.chr03 223342431 3e-80
CaES4377 Pepper.v.1.5.chr03 35352237 3e-22
CaES4384 Pepper.v.1.5.chr03 238179342 4e-49
CaES4399 Pepper.v.1.5.chr03 202128361 1e-116
CaES4400 Pepper.v.1.5.chr03 218641187 4e-97
CaES4411 Pepper.v.1.5.chr03 236018504 3e-97
CaES4424 Pepper.v.1.5.chr03 240508725 2e-81
CaES4427 Pepper.v.1.5.chr03 26827074 1e-118
CaES4444 Pepper.v.1.5.chr03 218701617 7e-60
CaES4445 Pepper.v.1.5.chr03 218758368 1e-133
CaES4447 Pepper.v.1.5.chr03 216265171 1e-123
CaES4460 Pepper.v.1.5.chr03 18305809 1e-105
CaES4463 Pepper.v.1.5.chr03 64144724 1e-122
CaES4474 Pepper.v.1.5.chr03 60008030 2e-79
CaES4533 Pepper.v.1.5.chr03 145890722 1e-130
CaES4546 Pepper.v.1.5.chr03 3704145 1e-119
CaES4555 Pepper.v.1.5.chr03 241012059 1e-77
CaES4557 Pepper.v.1.5.chr03 183884640 1e-128
CaES4558 Pepper.v.1.5.chr03 224852535 1e-110
CaES4566 Pepper.v.1.5.chr03 241520828 1e-132
CaES4590 Pepper.v.1.5.chr03 3745044 2e-33
CaES4614 Pepper.v.1.5.chr03 28425087 1e-115
CaES4634 Pepper.v.1.5.chr03 68890333 1e-111
CaES4636 Pepper.v.1.5.chr03 25908657 1e-137
CaES4643 Pepper.v.1.5.chr03 179335973 4e-65
CaES4647 Pepper.v.1.5.chr03 138307175 1e-129
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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