Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3688 Pepper.v.1.5.chr03 235456620 1e-79
CaES3713 Pepper.v.1.5.chr03 97838394 1e-113
CaES3719 Pepper.v.1.5.chr03 234764230 1e-140
CaES3741 Pepper.v.1.5.chr03 241268303 1e-121
CaES3749 Pepper.v.1.5.chr03 240825869 5e-39
CaES3753 Pepper.v.1.5.chr03 7559233 1e-104
CaES3769 Pepper.v.1.5.chr03 15018078 1e-108
CaES3776 Pepper.v.1.5.chr03 9218496 4e-80
CaES3777 Pepper.v.1.5.chr03 225176621 1e-154
CaES3806 Pepper.v.1.5.chr03 725239 1e-119
CaES3815 Pepper.v.1.5.chr03 237135869 1e-127
CaES3817 Pepper.v.1.5.chr03 204418166 1e-118
CaES3818 Pepper.v.1.5.chr03 26867304 1e-115
CaES3830 Pepper.v.1.5.chr03 4816602 1e-154
CaES3836 Pepper.v.1.5.chr03 214804185 1e-105
CaES3838 Pepper.v.1.5.chr03 241420886 1e-103
CaES3839 Pepper.v.1.5.chr03 239211927 1e-143
CaES3843 Pepper.v.1.5.chr03 27619251 1e-86
CaES3867 Pepper.v.1.5.chr03 26868473 1e-141
CaES3874 Pepper.v.1.5.chr03 32877495 1e-132
CaES3877 Pepper.v.1.5.chr03 11709869 1e-87
CaES3878 Pepper.v.1.5.chr03 219159541 1e-126
CaES3883 Pepper.v.1.5.chr03 223307654 1e-107
CaES3885 Pepper.v.1.5.chr03 281383 2e-98
CaES3892 Pepper.v.1.5.chr03 228186750 4e-96
CaES3894 Pepper.v.1.5.chr03 67167567 1e-112
CaES3900 Pepper.v.1.5.chr03 12232610 1e-98
CaES3905 Pepper.v.1.5.chr03 219144770 1e-107
CaES3911 Pepper.v.1.5.chr03 217207020 1e-144
CaES3915 Pepper.v.1.5.chr03 236334482 4e-91
CaES3920 Pepper.v.1.5.chr03 235263459 2e-81
CaES3929 Pepper.v.1.5.chr03 213670791 9e-36
CaES3931 Pepper.v.1.5.chr03 211913246 1e-141
CaES3944 Pepper.v.1.5.chr03 221451248 1e-127
CaES3953 Pepper.v.1.5.chr03 239350338 1e-88
CaES3970 Pepper.v.1.5.chr03 153746532 1e-129
CaES3971 Pepper.v.1.5.chr03 7949252 1e-116
CaES4016 Pepper.v.1.5.chr03 221309574 1e-104
CaES4033 Pepper.v.1.5.chr03 236255010 1e-129
CaES4055 Pepper.v.1.5.chr03 229395669 1e-145
CaES4061 Pepper.v.1.5.chr03 210657825 1e-121
CaES4066 Pepper.v.1.5.chr03 235188115 1e-27
CaES4069 Pepper.v.1.5.chr03 1945741 2e-84
CaES4081 Pepper.v.1.5.chr03 17762413 1e-135
CaES4085 Pepper.v.1.5.chr03 240442212 1e-107
CaES4095 Pepper.v.1.5.chr03 236555696 1e-140
CaES4101 Pepper.v.1.5.chr03 16113785 7e-50
CaES4104 Pepper.v.1.5.chr03 97012219 1e-146
CaES4112 Pepper.v.1.5.chr03 237768969 1e-46
CaES4123 Pepper.v.1.5.chr03 230747923 1e-79
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


MarkerDB | Capsicum annuum