Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3234 Pepper.v.1.5.chr03 4587337 1e-154
CaES3249 Pepper.v.1.5.chr03 201676243 1e-79
CaES3287 Pepper.v.1.5.chr03 29436210 3e-73
CaES3291 Pepper.v.1.5.chr03 19727593 2e-30
CaES3322 Pepper.v.1.5.chr03 5121630 1e-49
CaES3328 Pepper.v.1.5.chr03 93695339 6e-60
CaES3329 Pepper.v.1.5.chr03 216030091 3e-81
CaES3349 Pepper.v.1.5.chr03 234686682 1e-82
CaES3350 Pepper.v.1.5.chr03 18924954 1e-105
CaES3361 Pepper.v.1.5.chr03 175040525 8e-42
CaES3367 Pepper.v.1.5.chr03 1235724 1e-115
CaES3370 Pepper.v.1.5.chr03 7437581 3e-49
CaES3381 Pepper.v.1.5.chr03 20885974 6e-41
CaES3395 Pepper.v.1.5.chr03 14474782 2e-35
CaES3397 Pepper.v.1.5.chr03 225669222 1e-111
CaES3398 Pepper.v.1.5.chr03 29436293 1e-105
CaES3403 Pepper.v.1.5.chr03 226078664 1e-128
CaES3404 Pepper.v.1.5.chr03 202526065 7e-47
CaES3409 Pepper.v.1.5.chr03 234967464 1e-144
CaES3414 Pepper.v.1.5.chr03 19114385 1e-137
CaES3416 Pepper.v.1.5.chr03 223415980 4e-23
CaES3432 Pepper.v.1.5.chr03 240507945 1e-111
CaES3458 Pepper.v.1.5.chr03 186067804 1e-137
CaES3467 Pepper.v.1.5.chr03 13300357 9e-97
CaES3472 Pepper.v.1.5.chr03 223889138 9e-97
CaES3483 Pepper.v.1.5.chr03 5460367 3e-90
CaES3486 Pepper.v.1.5.chr03 150959020 1e-110
CaES3490 Pepper.v.1.5.chr03 240973535 1e-107
CaES3508 Pepper.v.1.5.chr03 215107112 4e-56
CaES3510 Pepper.v.1.5.chr03 18648467 1e-100
CaES3517 Pepper.v.1.5.chr03 225093995 5e-27
CaES3519 Pepper.v.1.5.chr03 44411162 4e-54
CaES3520 Pepper.v.1.5.chr03 193572010 1e-120
CaES3522 Pepper.v.1.5.chr03 74804041 1e-112
CaES3528 Pepper.v.1.5.chr03 20862553 4e-99
CaES3546 Pepper.v.1.5.chr03 216437418 9e-58
CaES3549 Pepper.v.1.5.chr03 131689969 1e-141
CaES3566 Pepper.v.1.5.chr03 29435707 1e-103
CaES3569 Pepper.v.1.5.chr03 204459901 1e-100
CaES3573 Pepper.v.1.5.chr03 239178560 4e-24
CaES3576 Pepper.v.1.5.chr03 4882026 4e-85
CaES3600 Pepper.v.1.5.chr03 11254243 1e-126
CaES3604 Pepper.v.1.5.chr03 236146402 1e-107
CaES3618 Pepper.v.1.5.chr03 215125273 1e-95
CaES3632 Pepper.v.1.5.chr03 18190283 1e-138
CaES3641 Pepper.v.1.5.chr03 236977964 1e-25
CaES3667 Pepper.v.1.5.chr03 158404389 6e-63
CaES3674 Pepper.v.1.5.chr03 240909337 1e-153
CaES3682 Pepper.v.1.5.chr03 234892940 3e-95
CaES3685 Pepper.v.1.5.chr03 5623120 1e-148
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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