Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2689 Pepper.v.1.5.chr03 16232990 6e-90
CaES2696 Pepper.v.1.5.chr03 236188497 2e-26
CaES2723 Pepper.v.1.5.chr03 176518631 2e-71
CaES2725 Pepper.v.1.5.chr03 18952168 1e-127
CaES2733 Pepper.v.1.5.chr03 20560041 5e-93
CaES2740 Pepper.v.1.5.chr03 221311308 1e-106
CaES2754 Pepper.v.1.5.chr03 51096740 2e-30
CaES2756 Pepper.v.1.5.chr03 240976609 9e-83
CaES2773 Pepper.v.1.5.chr03 22101364 1e-111
CaES2787 Pepper.v.1.5.chr03 219165138 5e-96
CaES2792 Pepper.v.1.5.chr03 2449269 6e-26
CaES2803 Pepper.v.1.5.chr03 29432328 1e-106
CaES2805 Pepper.v.1.5.chr03 5838236 1e-138
CaES2818 Pepper.v.1.5.chr03 185115508 1e-140
CaES2823 Pepper.v.1.5.chr03 204593190 2e-73
CaES2866 Pepper.v.1.5.chr03 5067654 1e-129
CaES2874 Pepper.v.1.5.chr03 17904243 5e-38
CaES2876 Pepper.v.1.5.chr03 134281745 1e-115
CaES2893 Pepper.v.1.5.chr03 220697700 2e-99
CaES2895 Pepper.v.1.5.chr03 173884613 1e-126
CaES2902 Pepper.v.1.5.chr03 23451045 1e-115
CaES2916 Pepper.v.1.5.chr03 238262107 1e-105
CaES2923 Pepper.v.1.5.chr03 42534240 1e-159
CaES2941 Pepper.v.1.5.chr03 214282074 1e-101
CaES2963 Pepper.v.1.5.chr03 197546877 1e-143
CaES2967 Pepper.v.1.5.chr03 13993821 1e-103
CaES2991 Pepper.v.1.5.chr03 89902021 1e-145
CaES3015 Pepper.v.1.5.chr03 4100896 1e-134
CaES3022 Pepper.v.1.5.chr03 205747215 3e-97
CaES3025 Pepper.v.1.5.chr03 238291818 2e-22
CaES3036 Pepper.v.1.5.chr03 26097574 1e-139
CaES3037 Pepper.v.1.5.chr03 210666909 1e-133
CaES3039 Pepper.v.1.5.chr03 228998851 6e-59
CaES3051 Pepper.v.1.5.chr03 1216785 2e-82
CaES3066 Pepper.v.1.5.chr03 47755881 1e-130
CaES3068 Pepper.v.1.5.chr03 236023360 1e-104
CaES3081 Pepper.v.1.5.chr03 29493793 1e-109
CaES3082 Pepper.v.1.5.chr03 18924596 1e-116
CaES3083 Pepper.v.1.5.chr03 27436225 1e-110
CaES3091 Pepper.v.1.5.chr03 240904698 2e-47
CaES3092 Pepper.v.1.5.chr03 67168289 1e-136
CaES3102 Pepper.v.1.5.chr03 30175323 1e-138
CaES3113 Pepper.v.1.5.chr03 75765226 1e-126
CaES3151 Pepper.v.1.5.chr03 238772100 1e-146
CaES3208 Pepper.v.1.5.chr03 234671077 1e-118
CaES3210 Pepper.v.1.5.chr03 232274183 1e-152
CaES3218 Pepper.v.1.5.chr03 236808416 2e-76
CaES3222 Pepper.v.1.5.chr03 225955242 8e-52
CaES3225 Pepper.v.1.5.chr03 34296400 1e-85
CaES3228 Pepper.v.1.5.chr03 129636630 1e-140
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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