Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2166 Pepper.v.1.5.chr03 148447629 6e-61
CaES1315 Pepper.v.1.5.chr03 148505778 3e-98
CaES3486 Pepper.v.1.5.chr03 150959020 1e-110
CaES3970 Pepper.v.1.5.chr03 153746532 1e-129
CaES4772 Pepper.v.1.5.chr03 156643372 1e-101
CaES2595 Pepper.v.1.5.chr03 156675450 1e-90
CaES0518 Pepper.v.1.5.chr03 157753512 3e-67
CaES1735 Pepper.v.1.5.chr03 157878944 2e-80
CaES5320 Pepper.v.1.5.chr03 157878992 1e-56
CaES3667 Pepper.v.1.5.chr03 158404389 6e-63
CaES0023 Pepper.v.1.5.chr03 162006299 2e-50
CaES1771 Pepper.v.1.5.chr03 167379287 1e-70
CaES5611 Pepper.v.1.5.chr03 167392623 2e-63
CaES5638 Pepper.v.1.5.chr03 171239710 1e-121
CaES2895 Pepper.v.1.5.chr03 173884613 1e-126
CaES0675 Pepper.v.1.5.chr03 174652362 3e-84
CaES3361 Pepper.v.1.5.chr03 175040525 8e-42
CaES4348 Pepper.v.1.5.chr03 175161288 1e-131
CaES2723 Pepper.v.1.5.chr03 176518631 2e-71
CaES0212 Pepper.v.1.5.chr03 178877860 1e-117
CaES4643 Pepper.v.1.5.chr03 179335973 4e-65
CaES0092 Pepper.v.1.5.chr03 180847739 3e-36
CaES0976 Pepper.v.1.5.chr03 181241666 1e-145
CaES1370 Pepper.v.1.5.chr03 183551752 1e-105
CaES0789 Pepper.v.1.5.chr03 183798725 1e-141
CaES4557 Pepper.v.1.5.chr03 183884640 1e-128
CaES0973 Pepper.v.1.5.chr03 183918007 1e-126
CaES5419 Pepper.v.1.5.chr03 184530439 8e-57
CaES1385 Pepper.v.1.5.chr03 184863108 2e-66
CaES1206 Pepper.v.1.5.chr03 184870120 1e-108
CaES2818 Pepper.v.1.5.chr03 185115508 1e-140
CaES3458 Pepper.v.1.5.chr03 186067804 1e-137
CaES3520 Pepper.v.1.5.chr03 193572010 1e-120
CaES0556 Pepper.v.1.5.chr03 194004536 1e-139
CaES2155 Pepper.v.1.5.chr03 196220843 4e-43
CaES0370 Pepper.v.1.5.chr03 196340327 1e-136
CaES2963 Pepper.v.1.5.chr03 197546877 1e-143
CaES2440 Pepper.v.1.5.chr03 197774142 9e-49
CaES5023 Pepper.v.1.5.chr03 197827871 1e-139
CaES1725 Pepper.v.1.5.chr03 198324249 1e-110
CaES0543 Pepper.v.1.5.chr03 200567150 2e-36
CaES0096 Pepper.v.1.5.chr03 200610610 6e-61
CaES1487 Pepper.v.1.5.chr03 200680842 1e-120
CaES5018 Pepper.v.1.5.chr03 201135071 1e-139
CaES2469 Pepper.v.1.5.chr03 201269689 5e-70
CaES0769 Pepper.v.1.5.chr03 201271238 4e-46
CaES3249 Pepper.v.1.5.chr03 201676243 1e-79
CaES4399 Pepper.v.1.5.chr03 202128361 1e-116
CaES5402 Pepper.v.1.5.chr03 202129057 3e-65
CaES2266 Pepper.v.1.5.chr03 202129331 1e-142
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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