Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2151 Pepper.v.1.5.chr03 126507014 1e-141
CaES2155 Pepper.v.1.5.chr03 196220843 4e-43
CaES2156 Pepper.v.1.5.chr03 217160932 1e-107
CaES2166 Pepper.v.1.5.chr03 148447629 6e-61
CaES2180 Pepper.v.1.5.chr03 231437239 5e-98
CaES2185 Pepper.v.1.5.chr03 214402832 1e-102
CaES2199 Pepper.v.1.5.chr03 225324705 2e-83
CaES2206 Pepper.v.1.5.chr03 47991618 1e-172
CaES2229 Pepper.v.1.5.chr03 129761111 4e-36
CaES2245 Pepper.v.1.5.chr03 4600121 1e-109
CaES2259 Pepper.v.1.5.chr03 237201013 2e-40
CaES2266 Pepper.v.1.5.chr03 202129331 1e-142
CaES2282 Pepper.v.1.5.chr03 239845190 1e-84
CaES2292 Pepper.v.1.5.chr03 2040 4e-92
CaES2301 Pepper.v.1.5.chr03 214275631 1e-132
CaES2308 Pepper.v.1.5.chr03 2877593 1e-104
CaES2310 Pepper.v.1.5.chr03 144408281 1e-100
CaES2361 Pepper.v.1.5.chr03 233007595 1e-110
CaES2371 Pepper.v.1.5.chr03 241710776 2e-62
CaES2385 Pepper.v.1.5.chr03 231849865 2e-64
CaES2394 Pepper.v.1.5.chr03 127413360 1e-51
CaES2419 Pepper.v.1.5.chr03 6253281 1e-125
CaES2440 Pepper.v.1.5.chr03 197774142 9e-49
CaES2442 Pepper.v.1.5.chr03 228740467 5e-98
CaES2457 Pepper.v.1.5.chr03 2858431 1e-56
CaES2469 Pepper.v.1.5.chr03 201269689 5e-70
CaES2471 Pepper.v.1.5.chr03 8403357 3e-69
CaES2495 Pepper.v.1.5.chr03 58313142 5e-31
CaES2496 Pepper.v.1.5.chr03 1024383 1e-84
CaES2498 Pepper.v.1.5.chr03 225385752 2e-65
CaES2505 0.288 192 Pepper.v.1.5.chr03 45414882 1e-105
CaES2521 Pepper.v.1.5.chr03 18458859 4e-39
CaES2546 Pepper.v.1.5.chr03 235783099 1e-77
CaES2550 Pepper.v.1.5.chr03 1744888 1e-134
CaES2553 Pepper.v.1.5.chr03 213714687 3e-21
CaES2560 Pepper.v.1.5.chr03 4744241 3e-71
CaES2574 Pepper.v.1.5.chr03 238110659 1e-143
CaES2578 Pepper.v.1.5.chr03 217591303 1e-130
CaES2591 Pepper.v.1.5.chr03 132280945 1e-112
CaES2595 Pepper.v.1.5.chr03 156675450 1e-90
CaES2617 Pepper.v.1.5.chr03 209971858 1e-114
CaES2618 Pepper.v.1.5.chr03 21228998 1e-117
CaES2633 Pepper.v.1.5.chr03 235943665 1e-157
CaES2648 Pepper.v.1.5.chr03 42376182 1e-122
CaES2655 0.704 189 Pepper.v.1.5.chr03 5156778 1e-126
CaES2660 Pepper.v.1.5.chr03 216610711 1e-136
CaES2666 0.381 191 Pepper.v.1.5.chr03 10330496 1e-136
CaES2678 Pepper.v.1.5.chr03 4878608 1e-137
CaES2684 Pepper.v.1.5.chr03 232210662 1e-135
CaES2687 Pepper.v.1.5.chr03 18156685 1e-141
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568

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