Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1615 Pepper.v.1.5.chr03 137023850 1e-127
CaES1617 Pepper.v.1.5.chr03 220625743 2e-65
CaES1618 Pepper.v.1.5.chr03 217659889 3e-43
CaES1624 Pepper.v.1.5.chr03 241524717 1e-121
CaES1643 Pepper.v.1.5.chr03 241420243 1e-149
CaES1655 Pepper.v.1.5.chr03 232717253 1e-117
CaES1664 Pepper.v.1.5.chr03 236342010 3e-64
CaES1685 Pepper.v.1.5.chr03 224125887 1e-111
CaES1699 Pepper.v.1.5.chr03 16231414 9e-69
CaES1710 Pepper.v.1.5.chr03 29437439 1e-126
CaES1719 Pepper.v.1.5.chr03 9169743 1e-124
CaES1722 Pepper.v.1.5.chr03 1173430 1e-111
CaES1725 Pepper.v.1.5.chr03 198324249 1e-110
CaES1735 Pepper.v.1.5.chr03 157878944 2e-80
CaES1771 Pepper.v.1.5.chr03 167379287 1e-70
CaES1776 Pepper.v.1.5.chr03 235271417 3e-43
CaES1812 Pepper.v.1.5.chr03 240624121 1e-113
CaES1841 Pepper.v.1.5.chr03 226080286 1e-72
CaES1843 Pepper.v.1.5.chr03 211327636 1e-150
CaES1847 Pepper.v.1.5.chr03 68897979 2e-27
CaES1875 Pepper.v.1.5.chr03 20696790 2e-30
CaES1876 Pepper.v.1.5.chr03 2846 9e-54
CaES1878 Pepper.v.1.5.chr03 225488457 2e-45
CaES1882 Pepper.v.1.5.chr03 67553485 1e-100
CaES1900 Pepper.v.1.5.chr03 14474782 4e-37
CaES1906 Pepper.v.1.5.chr03 28267755 2e-42
CaES1912 Pepper.v.1.5.chr03 239883740 1e-114
CaES1915 Pepper.v.1.5.chr03 223916411 2e-79
CaES1927 Pepper.v.1.5.chr03 13101580 1e-123
CaES1942 Pepper.v.1.5.chr03 220904265 1e-120
CaES1945 Pepper.v.1.5.chr03 235962563 1e-60
CaES1949 Pepper.v.1.5.chr03 15646462 1e-162
CaES1954 Pepper.v.1.5.chr03 218784412 1e-124
CaES1957 Pepper.v.1.5.chr03 38799742 2e-83
CaES1958 Pepper.v.1.5.chr03 13057670 2e-79
CaES1959 Pepper.v.1.5.chr03 214913581 1e-125
CaES1963 Pepper.v.1.5.chr03 224673996 4e-92
CaES1974 Pepper.v.1.5.chr03 235382126 1e-120
CaES1984 Pepper.v.1.5.chr03 210279046 1e-119
CaES1989 Pepper.v.1.5.chr03 209851279 1e-90
CaES1998 Pepper.v.1.5.chr03 227514319 1e-138
CaES1999 Pepper.v.1.5.chr03 24844771 2e-65
CaES2006 Pepper.v.1.5.chr03 22530432 1e-55
CaES2074 Pepper.v.1.5.chr03 21821721 1e-136
CaES2088 Pepper.v.1.5.chr03 90221429 1e-119
CaES2094 Pepper.v.1.5.chr03 214422572 7e-95
CaES2101 Pepper.v.1.5.chr03 240660732 1e-108
CaES2110 Pepper.v.1.5.chr03 2888162 5e-26
CaES2134 Pepper.v.1.5.chr03 224887241 1e-144
CaES2144 Pepper.v.1.5.chr03 4816087 3e-89
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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