Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2689 Pepper.v.1.5.chr03 16232990 6e-90
CaES4842 Pepper.v.1.5.chr03 16681837 3e-46
CaES0072 Pepper.v.1.5.chr03 17399366 7e-93
CaES4081 Pepper.v.1.5.chr03 17762413 1e-135
CaES4341 Pepper.v.1.5.chr03 17787450 3e-72
CaES2874 Pepper.v.1.5.chr03 17904243 5e-38
CaES2687 Pepper.v.1.5.chr03 18156685 1e-141
CaES3632 Pepper.v.1.5.chr03 18190283 1e-138
CaES4460 Pepper.v.1.5.chr03 18305809 1e-105
CaES2521 Pepper.v.1.5.chr03 18458859 4e-39
CaES3510 Pepper.v.1.5.chr03 18648467 1e-100
CaES3082 Pepper.v.1.5.chr03 18924596 1e-116
CaES3350 Pepper.v.1.5.chr03 18924954 1e-105
CaES2725 Pepper.v.1.5.chr03 18952168 1e-127
CaES3414 Pepper.v.1.5.chr03 19114385 1e-137
CaES3291 Pepper.v.1.5.chr03 19727593 2e-30
CaES4959 Pepper.v.1.5.chr03 19727593 4e-58
CaES4674 Pepper.v.1.5.chr03 19923257 1e-139
CaES2733 Pepper.v.1.5.chr03 20560041 5e-93
CaES5094 Pepper.v.1.5.chr03 20637916 1e-157
CaES1875 Pepper.v.1.5.chr03 20696790 2e-30
CaES1186 Pepper.v.1.5.chr03 20794676 1e-101
CaES0385 Pepper.v.1.5.chr03 20799712 2e-91
CaES3528 Pepper.v.1.5.chr03 20862553 4e-99
CaES3381 Pepper.v.1.5.chr03 20885974 6e-41
CaES5747 Pepper.v.1.5.chr03 20886214 2e-45
CaES1520 Pepper.v.1.5.chr03 20918163 1e-144
CaES4804 Pepper.v.1.5.chr03 20919049 1e-117
CaES1513 Pepper.v.1.5.chr03 21019568 1e-47
CaES4282 Pepper.v.1.5.chr03 21077825 2e-93
CaES4369 Pepper.v.1.5.chr03 21147177 1e-137
CaES0191 Pepper.v.1.5.chr03 21151149 1e-148
CaES2618 Pepper.v.1.5.chr03 21228998 1e-117
CaES5746 Pepper.v.1.5.chr03 21272193 5e-77
CaES0785 Pepper.v.1.5.chr03 21349787 5e-66
CaES4812 Pepper.v.1.5.chr03 21402362 3e-46
CaES2074 Pepper.v.1.5.chr03 21821721 1e-136
CaES5207 Pepper.v.1.5.chr03 21837021 5e-55
CaES2773 Pepper.v.1.5.chr03 22101364 1e-111
CaES4835 Pepper.v.1.5.chr03 22179863 1e-139
CaES1196 Pepper.v.1.5.chr03 22528995 1e-117
CaES2006 Pepper.v.1.5.chr03 22530432 1e-55
CaES0059 Pepper.v.1.5.chr03 22795078 5e-47
CaES5620 Pepper.v.1.5.chr03 23450846 5e-99
CaES2902 Pepper.v.1.5.chr03 23451045 1e-115
CaES1351 Pepper.v.1.5.chr03 23645805 1e-133
CaES4791 Pepper.v.1.5.chr03 24767328 7e-68
CaES5215 Pepper.v.1.5.chr03 24817929 2e-88
CaES1999 Pepper.v.1.5.chr03 24844771 2e-65
CaES1497 Pepper.v.1.5.chr03 25164875 7e-88
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568

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