Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0996 Pepper.v.1.5.chr03 236639621 3e-48
CaES1022 Pepper.v.1.5.chr03 230654459 1e-122
CaES1045 Pepper.v.1.5.chr03 240248323 1e-128
CaES1056 Pepper.v.1.5.chr03 231160559 1e-133
CaES1072 Pepper.v.1.5.chr03 230571615 1e-88
CaES1073 Pepper.v.1.5.chr03 75002745 1e-111
CaES1107 Pepper.v.1.5.chr03 239521947 1e-154
CaES1119 Pepper.v.1.5.chr03 74981997 1e-54
CaES1145 Pepper.v.1.5.chr03 4662973 2e-22
CaES1171 Pepper.v.1.5.chr03 225385740 1e-154
CaES1186 Pepper.v.1.5.chr03 20794676 1e-101
CaES1189 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr03 223235873 1e-112
CaES1196 Pepper.v.1.5.chr03 22528995 1e-117
CaES1206 Pepper.v.1.5.chr03 184870120 1e-108
CaES1234 Pepper.v.1.5.chr03 225177981 1e-137
CaES1263 Pepper.v.1.5.chr03 8858172 5e-39
CaES1275 Pepper.v.1.5.chr03 237453935 1e-162
CaES1289 Pepper.v.1.5.chr03 1749624 2e-81
CaES1295 Pepper.v.1.5.chr03 15589539 3e-97
CaES1299 Pepper.v.1.5.chr03 240553865 1e-43
CaES1307 Pepper.v.1.5.chr03 216431568 6e-70
CaES1315 Pepper.v.1.5.chr03 148505778 3e-98
CaES1322 Pepper.v.1.5.chr03 236188497 7e-22
CaES1323 Pepper.v.1.5.chr03 240053391 1e-49
CaES1331 Pepper.v.1.5.chr03 213194399 1e-104
CaES1340 Pepper.v.1.5.chr03 67014841 1e-147
CaES1343 Pepper.v.1.5.chr03 239140456 2e-94
CaES1351 Pepper.v.1.5.chr03 23645805 1e-133
CaES1370 Pepper.v.1.5.chr03 183551752 1e-105
CaES1385 Pepper.v.1.5.chr03 184863108 2e-66
CaES1416 Pepper.v.1.5.chr03 226992669 1e-106
CaES1439 Pepper.v.1.5.chr03 214056540 1e-140
CaES1450 Pepper.v.1.5.chr03 241709862 3e-73
CaES1457 Pepper.v.1.5.chr03 31926840 1e-121
CaES1471 Pepper.v.1.5.chr03 25260749 6e-99
CaES1487 Pepper.v.1.5.chr03 200680842 1e-120
CaES1497 Pepper.v.1.5.chr03 25164875 7e-88
CaES1502 Pepper.v.1.5.chr03 214022521 2e-66
CaES1512 Pepper.v.1.5.chr03 220722386 3e-85
CaES1513 Pepper.v.1.5.chr03 21019568 1e-47
CaES1514 Pepper.v.1.5.chr03 218702258 5e-95
CaES1520 Pepper.v.1.5.chr03 20918163 1e-144
CaES1523 Pepper.v.1.5.chr03 240554194 4e-98
CaES1532 Pepper.v.1.5.chr03 76597023 6e-44
CaES1543 Pepper.v.1.5.chr03 240660759 4e-76
CaES1549 Pepper.v.1.5.chr03 237499964 2e-31
CaES1563 Pepper.v.1.5.chr03 39185877 5e-41
CaES1593 Pepper.v.1.5.chr03 32109045 1e-106
CaES1594 Pepper.v.1.5.chr03 16113617 8e-44
CaES1603 Pepper.v.1.5.chr03 74804583 1e-109
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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