Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0489 Pepper.v.1.5.chr03 221525422 3e-23
CaES0498 Pepper.v.1.5.chr03 232206010 2e-66
CaES0517 Pepper.v.1.5.chr03 25255878 4e-57
CaES0518 Pepper.v.1.5.chr03 157753512 3e-67
CaES0527 Pepper.v.1.5.chr03 240050755 9e-63
CaES0543 Pepper.v.1.5.chr03 200567150 2e-36
CaES0544 Pepper.v.1.5.chr03 31502277 4e-87
CaES0552 Pepper.v.1.5.chr03 1774971 3e-80
CaES0556 Pepper.v.1.5.chr03 194004536 1e-139
CaES0559 Pepper.v.1.5.chr03 3776865 2e-25
CaES0563 Pepper.v.1.5.chr03 50745955 2e-80
CaES0566 Pepper.v.1.5.chr03 214341315 2e-40
CaES0572 Pepper.v.1.5.chr03 233186768 1e-122
CaES0579 Pepper.v.1.5.chr03 213723768 2e-61
CaES0630 Pepper.v.1.5.chr03 232475993 1e-125
CaES0649 Pepper.v.1.5.chr03 3721091 1e-120
CaES0663 0.461 180 Pepper.v.1.5.chr03 234804166 1e-102
CaES0675 Pepper.v.1.5.chr03 174652362 3e-84
CaES0710 Pepper.v.1.5.chr03 8020780 1e-111
CaES0712 Pepper.v.1.5.chr03 202504545 1e-90
CaES0713 Pepper.v.1.5.chr03 235583937 1e-145
CaES0724 Pepper.v.1.5.chr03 214095254 1e-123
CaES0730 Pepper.v.1.5.chr03 211859747 1e-117
CaES0737 Pepper.v.1.5.chr03 231471554 1e-133
CaES0749 Pepper.v.1.5.chr03 212310097 1e-160
CaES0769 Pepper.v.1.5.chr03 201271238 4e-46
CaES0777 Pepper.v.1.5.chr03 4578375 1e-139
CaES0785 Pepper.v.1.5.chr03 21349787 5e-66
CaES0789 Pepper.v.1.5.chr03 183798725 1e-141
CaES0808 Pepper.v.1.5.chr03 241515865 5e-74
CaES0821 Pepper.v.1.5.chr03 232716732 8e-93
CaES0825 Pepper.v.1.5.chr03 78399716 1e-102
CaES0829 Pepper.v.1.5.chr03 118670210 2e-64
CaES0835 Pepper.v.1.5.chr03 235281888 6e-76
CaES0837 Pepper.v.1.5.chr03 13058963 6e-58
CaES0851 Pepper.v.1.5.chr03 4524371 1e-129
CaES0870 Pepper.v.1.5.chr03 231465211 3e-45
CaES0877 Pepper.v.1.5.chr03 104768520 7e-97
CaES0892 Pepper.v.1.5.chr03 38802722 3e-86
CaES0898 Pepper.v.1.5.chr03 4102257 1e-137
CaES0901 Pepper.v.1.5.chr03 67629884 1e-149
CaES0911 Pepper.v.1.5.chr03 236640664 1e-118
CaES0916 Pepper.v.1.5.chr03 5687943 2e-48
CaES0929 Pepper.v.1.5.chr03 232650527 1e-116
CaES0941 Pepper.v.1.5.chr03 222973554 1e-113
CaES0973 Pepper.v.1.5.chr03 183918007 1e-126
CaES0976 Pepper.v.1.5.chr03 181241666 1e-145
CaES0979 Pepper.v.1.5.chr03 4462528 2e-26
CaES0986 Pepper.v.1.5.chr03 223957514 1e-153
CaES0990 Pepper.v.1.5.chr03 30597732 1e-106
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568

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