Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5141 Pepper.v.1.5.chr03 62726285 2e-53
CaES5148 Pepper.v.1.5.chr03 238532909 3e-35
CaES5158 Pepper.v.1.5.chr03 2430371 4e-97
CaES5169 Pepper.v.1.5.chr03 126869433 1e-148
CaES5178 0.306 172 Pepper.v.1.5.chr03 235068439 1e-117
CaES5182 Pepper.v.1.5.chr03 230591895 9e-42
CaES5185 Pepper.v.1.5.chr03 241233094 4e-90
CaES5187 Pepper.v.1.5.chr03 238551497 1e-123
CaES5193 Pepper.v.1.5.chr03 1448531 1e-155
CaES5207 Pepper.v.1.5.chr03 21837021 5e-55
CaES5214 Pepper.v.1.5.chr03 237847304 1e-64
CaES5215 Pepper.v.1.5.chr03 24817929 2e-88
CaES5250 Pepper.v.1.5.chr03 236851119 2e-78
CaES5259 Pepper.v.1.5.chr03 93280064 1e-155
CaES5272 Pepper.v.1.5.chr03 216354572 1e-93
CaES5273 Pepper.v.1.5.chr03 211765517 6e-82
CaES5286 Pepper.v.1.5.chr03 11685477 1e-90
CaES5302 Pepper.v.1.5.chr03 143374599 4e-56
CaES5306 Pepper.v.1.5.chr03 2223882 1e-112
CaES5320 Pepper.v.1.5.chr03 157878992 1e-56
CaES5336 Pepper.v.1.5.chr03 3744975 1e-101
CaES5351 Pepper.v.1.5.chr03 236183114 1e-113
CaES5374 Pepper.v.1.5.chr03 203252878 7e-71
CaES5389 Pepper.v.1.5.chr03 229396260 9e-52
CaES5391 Pepper.v.1.5.chr03 28424985 1e-67
CaES5399 Pepper.v.1.5.chr03 1026016 1e-98
CaES5402 Pepper.v.1.5.chr03 202129057 3e-65
CaES5407 Pepper.v.1.5.chr03 13321585 1e-140
CaES5411 Pepper.v.1.5.chr03 40061815 2e-84
CaES5419 Pepper.v.1.5.chr03 184530439 8e-57
CaES5437 Pepper.v.1.5.chr03 231763202 4e-33
CaES5441 Pepper.v.1.5.chr03 5605051 2e-33
CaES5450 Pepper.v.1.5.chr03 8228999 6e-91
CaES5478 Pepper.v.1.5.chr03 232734185 6e-46
CaES5526 Pepper.v.1.5.chr03 237728672 1e-85
CaES5541 Pepper.v.1.5.chr03 240414067 2e-90
CaES5544 Pepper.v.1.5.chr03 8395589 1e-124
CaES5558 Pepper.v.1.5.chr03 214400511 7e-79
CaES5568 Pepper.v.1.5.chr03 109548798 1e-102
CaES5572 Pepper.v.1.5.chr03 4815998 1e-66
CaES5573 Pepper.v.1.5.chr03 228095084 1e-104
CaES5574 Pepper.v.1.5.chr03 238290873 2e-87
CaES5583 Pepper.v.1.5.chr03 40043822 2e-66
CaES5590 Pepper.v.1.5.chr03 94643286 1e-133
CaES5609 Pepper.v.1.5.chr03 68235144 3e-95
CaES5611 Pepper.v.1.5.chr03 167392623 2e-63
CaES5619 Pepper.v.1.5.chr03 224208984 1e-133
CaES5620 Pepper.v.1.5.chr03 23450846 5e-99
CaES5625 Pepper.v.1.5.chr03 226311560 1e-103
CaES5638 Pepper.v.1.5.chr03 171239710 1e-121
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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