Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4864 Pepper.v.1.5.chr03 237712206 1e-127
CaES5526 Pepper.v.1.5.chr03 237728672 1e-85
CaES4131 Pepper.v.1.5.chr03 237763350 1e-151
CaES4112 Pepper.v.1.5.chr03 237768969 1e-46
CaES0371 Pepper.v.1.5.chr03 237838187 3e-96
CaES5214 Pepper.v.1.5.chr03 237847304 1e-64
CaES0064 Pepper.v.1.5.chr03 237875900 1e-91
CaES2574 Pepper.v.1.5.chr03 238110659 1e-143
CaES4384 Pepper.v.1.5.chr03 238179342 4e-49
CaES4779 Pepper.v.1.5.chr03 238215118 4e-43
CaES0204 Pepper.v.1.5.chr03 238260841 7e-81
CaES4288 Pepper.v.1.5.chr03 238261760 1e-117
CaES2916 Pepper.v.1.5.chr03 238262107 1e-105
CaES5574 Pepper.v.1.5.chr03 238290873 2e-87
CaES3025 Pepper.v.1.5.chr03 238291818 2e-22
CaES5148 Pepper.v.1.5.chr03 238532909 3e-35
CaES5187 Pepper.v.1.5.chr03 238551497 1e-123
CaES3151 Pepper.v.1.5.chr03 238772100 1e-146
CaES4827 Pepper.v.1.5.chr03 239003987 1e-130
CaES5739 Pepper.v.1.5.chr03 239109586 3e-85
CaES1343 Pepper.v.1.5.chr03 239140456 2e-94
CaES5036 Pepper.v.1.5.chr03 239142624 1e-149
CaES3573 Pepper.v.1.5.chr03 239178560 4e-24
CaES3839 Pepper.v.1.5.chr03 239211927 1e-143
CaES4200 Pepper.v.1.5.chr03 239293078 1e-100
CaES3953 Pepper.v.1.5.chr03 239350338 1e-88
CaES1107 Pepper.v.1.5.chr03 239521947 1e-154
CaES4897 Pepper.v.1.5.chr03 239574690 4e-83
CaES0225 Pepper.v.1.5.chr03 239585369 1e-108
CaES2282 Pepper.v.1.5.chr03 239845190 1e-84
CaES1912 Pepper.v.1.5.chr03 239883740 1e-114
CaES0527 Pepper.v.1.5.chr03 240050755 9e-63
CaES1323 Pepper.v.1.5.chr03 240053391 1e-49
CaES0125 Pepper.v.1.5.chr03 240113343 1e-108
CaES4899 Pepper.v.1.5.chr03 240115142 5e-22
CaES4715 Pepper.v.1.5.chr03 240248125 1e-107
CaES1045 Pepper.v.1.5.chr03 240248323 1e-128
CaES5541 Pepper.v.1.5.chr03 240414067 2e-90
CaES4085 Pepper.v.1.5.chr03 240442212 1e-107
CaES4721 Pepper.v.1.5.chr03 240443791 1e-115
CaES0079 Pepper.v.1.5.chr03 240463224 1e-115
CaES4815 Pepper.v.1.5.chr03 240492851 1e-131
CaES3432 Pepper.v.1.5.chr03 240507945 1e-111
CaES4424 Pepper.v.1.5.chr03 240508725 2e-81
CaES4881 Pepper.v.1.5.chr03 240537871 8e-44
CaES1299 Pepper.v.1.5.chr03 240553865 1e-43
CaES1523 Pepper.v.1.5.chr03 240554194 4e-98
CaES1812 Pepper.v.1.5.chr03 240624121 1e-113
CaES2101 Pepper.v.1.5.chr03 240660732 1e-108
CaES1543 Pepper.v.1.5.chr03 240660759 4e-76
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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