Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0929 Pepper.v.1.5.chr03 232650527 1e-116
CaES0052 Pepper.v.1.5.chr03 232716638 2e-28
CaES0821 Pepper.v.1.5.chr03 232716732 8e-93
CaES1655 Pepper.v.1.5.chr03 232717253 1e-117
CaES5478 Pepper.v.1.5.chr03 232734185 6e-46
CaES2361 Pepper.v.1.5.chr03 233007595 1e-110
CaES0572 Pepper.v.1.5.chr03 233186768 1e-122
CaES3208 Pepper.v.1.5.chr03 234671077 1e-118
CaES3349 Pepper.v.1.5.chr03 234686682 1e-82
CaES3719 Pepper.v.1.5.chr03 234764230 1e-140
CaES4142 Pepper.v.1.5.chr03 234801149 1e-121
CaES0132 Pepper.v.1.5.chr03 234805126 4e-36
CaES0227 Pepper.v.1.5.chr03 234890027 1e-120
CaES3682 Pepper.v.1.5.chr03 234892940 3e-95
CaES3409 Pepper.v.1.5.chr03 234967464 1e-144
CaES4066 Pepper.v.1.5.chr03 235188115 1e-27
CaES3920 Pepper.v.1.5.chr03 235263459 2e-81
CaES1776 Pepper.v.1.5.chr03 235271417 3e-43
CaES0835 Pepper.v.1.5.chr03 235281888 6e-76
CaES5120 Pepper.v.1.5.chr03 235287202 1e-149
CaES1974 Pepper.v.1.5.chr03 235382126 1e-120
CaES4179 Pepper.v.1.5.chr03 235434655 4e-46
CaES3688 Pepper.v.1.5.chr03 235456620 1e-79
CaES0713 Pepper.v.1.5.chr03 235583937 1e-145
CaES2546 Pepper.v.1.5.chr03 235783099 1e-77
CaES2633 Pepper.v.1.5.chr03 235943665 1e-157
CaES1945 Pepper.v.1.5.chr03 235962563 1e-60
CaES4411 Pepper.v.1.5.chr03 236018504 3e-97
CaES3068 Pepper.v.1.5.chr03 236023360 1e-104
CaES0339 Pepper.v.1.5.chr03 236110131 1e-112
CaES3604 Pepper.v.1.5.chr03 236146402 1e-107
CaES4168 Pepper.v.1.5.chr03 236146667 5e-76
CaES5351 Pepper.v.1.5.chr03 236183114 1e-113
CaES1322 Pepper.v.1.5.chr03 236188497 7e-22
CaES2696 Pepper.v.1.5.chr03 236188497 2e-26
CaES4033 Pepper.v.1.5.chr03 236255010 1e-129
CaES3915 Pepper.v.1.5.chr03 236334482 4e-91
CaES1664 Pepper.v.1.5.chr03 236342010 3e-64
CaES4095 Pepper.v.1.5.chr03 236555696 1e-140
CaES0996 Pepper.v.1.5.chr03 236639621 3e-48
CaES0911 Pepper.v.1.5.chr03 236640664 1e-118
CaES5689 Pepper.v.1.5.chr03 236786855 4e-99
CaES0232 Pepper.v.1.5.chr03 236795941 1e-123
CaES3218 Pepper.v.1.5.chr03 236808416 2e-76
CaES4232 Pepper.v.1.5.chr03 236845752 1e-121
CaES5250 Pepper.v.1.5.chr03 236851119 2e-78
CaES3641 Pepper.v.1.5.chr03 236977964 1e-25
CaES3815 Pepper.v.1.5.chr03 237135869 1e-127
CaES2259 Pepper.v.1.5.chr03 237201013 2e-40
CaES1275 Pepper.v.1.5.chr03 237453935 1e-162
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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