Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4651 Pepper.v.1.5.chr03 2232650 1e-149
CaES4674 Pepper.v.1.5.chr03 19923257 1e-139
CaES4685 Pepper.v.1.5.chr03 217949532 1e-106
CaES4688 Pepper.v.1.5.chr03 11532674 7e-67
CaES4699 Pepper.v.1.5.chr03 75309193 1e-42
CaES4715 Pepper.v.1.5.chr03 240248125 1e-107
CaES4721 Pepper.v.1.5.chr03 240443791 1e-115
CaES4728 Pepper.v.1.5.chr03 241724494 1e-111
CaES4733 Pepper.v.1.5.chr03 214053195 1e-129
CaES4750 Pepper.v.1.5.chr03 136511148 5e-96
CaES4763 Pepper.v.1.5.chr03 216027067 1e-153
CaES4772 Pepper.v.1.5.chr03 156643372 1e-101
CaES4779 Pepper.v.1.5.chr03 238215118 4e-43
CaES4782 Pepper.v.1.5.chr03 123812168 7e-64
CaES4791 Pepper.v.1.5.chr03 24767328 7e-68
CaES4796 Pepper.v.1.5.chr03 12114738 8e-80
CaES4804 Pepper.v.1.5.chr03 20919049 1e-117
CaES4812 Pepper.v.1.5.chr03 21402362 3e-46
CaES4815 Pepper.v.1.5.chr03 240492851 1e-131
CaES4827 Pepper.v.1.5.chr03 239003987 1e-130
CaES4835 Pepper.v.1.5.chr03 22179863 1e-139
CaES4838 Pepper.v.1.5.chr03 5115979 1e-94
CaES4842 Pepper.v.1.5.chr03 16681837 3e-46
CaES4864 Pepper.v.1.5.chr03 237712206 1e-127
CaES4869 Pepper.v.1.5.chr03 10251755 1e-116
CaES4878 Pepper.v.1.5.chr03 94653805 1e-105
CaES4881 Pepper.v.1.5.chr03 240537871 8e-44
CaES4897 Pepper.v.1.5.chr03 239574690 4e-83
CaES4899 Pepper.v.1.5.chr03 240115142 5e-22
CaES4906 Pepper.v.1.5.chr03 55395529 1e-126
CaES4919 Pepper.v.1.5.chr03 29539266 2e-80
CaES4930 Pepper.v.1.5.chr03 226841354 1e-118
CaES4946 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr03 241724221 1e-82
CaES4959 Pepper.v.1.5.chr03 19727593 4e-58
CaES4967 Pepper.v.1.5.chr03 83535643 1e-139
CaES4972 Pepper.v.1.5.chr03 231464921 3e-82
CaES4974 Pepper.v.1.5.chr03 220325469 1e-93
CaES4977 Pepper.v.1.5.chr03 2796041 1e-79
CaES5000 Pepper.v.1.5.chr03 225050859 1e-109
CaES5018 Pepper.v.1.5.chr03 201135071 1e-139
CaES5023 Pepper.v.1.5.chr03 197827871 1e-139
CaES5027 Pepper.v.1.5.chr03 202694898 2e-45
CaES5036 Pepper.v.1.5.chr03 239142624 1e-149
CaES5052 Pepper.v.1.5.chr03 48520804 1e-144
CaES5073 Pepper.v.1.5.chr03 225962909 1e-109
CaES5085 Pepper.v.1.5.chr03 147448974 2e-42
CaES5094 Pepper.v.1.5.chr03 20637916 1e-157
CaES5095 Pepper.v.1.5.chr03 217750548 2e-92
CaES5097 Pepper.v.1.5.chr03 70839568 1e-137
CaES5120 Pepper.v.1.5.chr03 235287202 1e-149
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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