Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2523 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 5787482 4e-59
CaES1169 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 9067531 7e-78
CaES3264 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr02 138395063 2e-96
CaES5024 0.0 180 Pepper.v.1.5.chr02 60620341 1e-150
CaES1112 0.499 190 Pepper.v.1.5.chr02 48575080 2e-72
CaES1137 0.236 190 Pepper.v.1.5.chr02 67587845 6e-83
CaES1208 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr02 102585278 1e-125
CaES2920 0.081 191 Pepper.v.1.5.chr02 162496068 1e-125
CaES0425 0.35 192 Pepper.v.1.5.chr02 40498773 1e-92
CaES1415 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 52333354 1e-128
CaES4710 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 146793182 1e-100
CaES2489 0.005 192 Pepper.v.1.5.chr02 154045458 1e-58
CaES3958 0.367 192 Pepper.v.1.5.chr02 158333086 2e-28
CaES3103 Pepper.v.1.5.chr02 1084377 3e-93
CaES5206 Pepper.v.1.5.chr02 1955625 1e-114
CaES2062 Pepper.v.1.5.chr02 2179652 1e-105
CaES0208 Pepper.v.1.5.chr02 2504915 1e-145
CaES5091 Pepper.v.1.5.chr02 2558993 1e-83
CaES1068 Pepper.v.1.5.chr02 2560059 1e-127
CaES4510 Pepper.v.1.5.chr02 3668064 3e-89
CaES4622 Pepper.v.1.5.chr02 3668064 8e-78
CaES1804 Pepper.v.1.5.chr02 4247909 3e-63
CaES4801 Pepper.v.1.5.chr02 4335012 2e-38
CaES3857 Pepper.v.1.5.chr02 4529170 2e-25
CaES2741 Pepper.v.1.5.chr02 4530908 8e-92
CaES4138 Pepper.v.1.5.chr02 4533155 1e-81
CaES0631 Pepper.v.1.5.chr02 5717113 1e-137
CaES3547 Pepper.v.1.5.chr02 5863289 1e-136
CaES2904 Pepper.v.1.5.chr02 5933847 1e-110
CaES2359 Pepper.v.1.5.chr02 6332653 2e-89
CaES5430 Pepper.v.1.5.chr02 8082568 5e-79
CaES5066 Pepper.v.1.5.chr02 12124893 3e-45
CaES0767 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-106
CaES0196 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-115
CaES3459 Pepper.v.1.5.chr02 12762453 1e-115
CaES1713 Pepper.v.1.5.chr02 12871808 5e-85
CaES5138 Pepper.v.1.5.chr02 13411732 1e-153
CaES1930 Pepper.v.1.5.chr02 14027393 1e-127
CaES3662 Pepper.v.1.5.chr02 14053301 1e-144
CaES1035 Pepper.v.1.5.chr02 15935297 1e-120
CaES2738 Pepper.v.1.5.chr02 16905736 1e-152
CaES1460 Pepper.v.1.5.chr02 17807141 2e-45
CaES4109 Pepper.v.1.5.chr02 19086840 1e-114
CaES3303 Pepper.v.1.5.chr02 19487613 1e-40
CaES0948 Pepper.v.1.5.chr02 23523135 1e-94
CaES0716 Pepper.v.1.5.chr02 25641510 1e-120
CaES1994 Pepper.v.1.5.chr02 26272592 2e-39
CaES4172 Pepper.v.1.5.chr02 26595219 6e-70
CaES2334 Pepper.v.1.5.chr02 26858061 5e-47
CaES2502 Pepper.v.1.5.chr02 27541661 4e-34
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

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